【摘 要】
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目前划分基因芯片种类主要通过以下几个方面:芯片上所点的DNA片段大小;点样的方法;将DNA连接到芯片上的化学方法和连接物;杂交和检测方法.在应用上相对广泛的则是cDNA基因芯
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目前划分基因芯片种类主要通过以下几个方面:芯片上所点的DNA片段大小;点样的方法;将DNA连接到芯片上的化学方法和连接物;杂交和检测方法.在应用上相对广泛的则是cDNA基因芯片和原位合成的寡核苷酸基因芯片.cDNA基因芯片是将DNA点到有覆盖物的玻璃表面上,通常在芯片3.6cm<2>区域内点样DNA达10,000个点;而寡核苷酸基因芯片更是在1.6cm<2>的区域内点样DNA达65,000-400,000个点.因此基因芯片可大量、快速、平行地对基因进行结构和表达的分析,为生物信息学的研究提供了一个重要的信息采集和处理平台.两种基因芯片相比较,在芯片设计、制作和杂交方面,寡核苷酸基因芯片较之于cDNA基因芯片有较多的优点.随着结构基因组学研究的不断深入,功能基因组学的研究已显得极为重要而紧迫.发现新基因和获知不同基因的功能是功能基因组学研究的主要任务,基因芯片在这个领域的研究中是一个作用巨大的技术工具.水稻是人类主要的食物,是三大粮食作物(水稻、小麦、玉米)之一.了解水稻的生长发育过程中不同器官中的基因表达情况将有助于理解水稻的生长发育机理,进而有助于指导水稻遗传育种.这是一个知之甚少的科学问题, 该研究首次采用由我们自己研制的寡核苷酸基因芯片对水稻孕穗期不同器官的基因表达进行了检测和研究.研究的主要内容及结果如下:1.总RNA的提取.获取水稻孕穗期的不同器官材料,分别进行总RNA的提取,检测并比较结果,优化RNA的提取过程.2.标记cDNA的反转录.将mRNA反转录出cDNA,反转录过程中用Cy3-dUTP标记cDNA,找出最佳的反转录方法.3.杂交.将Cy3-dUTP标记的cDNA与寡核苷酸基因芯片进行杂交,控制反应条件以取得最佳效果.4.检测.检测杂交的芯片,获取基因表达谱.5.结果比较分析.比较分析不同材料所取得的杂交结果,找出共同和特异表达的基因,推测出管家基因和奢侈基因.
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