大鼠心肌缺血/再灌注相关基因MIP5、USP38-S、MIP6-v1/v2、paxillinδ和klp5的克隆

来源 :中南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yingchaoya
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本研究采用生物信息学方法结合实验证实等手段克隆了几个缺血/再灌注诱导发生改变的新基因,并对其部分特性进行了分析和实验研究。   研究结果表明:大鼠心肌缺血/再灌注诱导表达上调新基因MIP5,其最大开放阅读框(openreadingframe,ORF)为909bp,编码302个氨基酸,该基因的Genbank登录号为AY553870,定位于大鼠染色体13q21,含8个外显子和7个内含子。基因MIP5在心、脾、脑、肾、肺、睾丸等大鼠多个主要组织有较高水平表达,但在骨骼肌和肝脏中表达甚少。生物信息学分析显示MIP5编码蛋白含6个kelch重复基序,为典型的kelch蛋白家族成员。克隆了USP38-S、MIP6-v1/v2、paxillinδ和klp5等大鼠心肌缺血/再灌注相关基因,并对其染色体定位,外显子在基因组中的排布,内含子的剪切,同源序列,编码氨基酸的结构等多种特性进行了生物信息学分析和部分实验研究。
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