AFF1在调控PolⅡ暂停和释放过程中的功能研究

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在后生动物细胞中,RNA聚合酶Ⅱ(PolⅡ)在近启动子位置处的暂停和释放调节是转录延伸过程中的一个关键性步骤。转录起始后,PolⅡ在转录前起始复合物PIC的作用下向下游转录约20-60碱基的距离,随后在DRB敏感性诱导因子DSIF和负性转录延伸因子NELF的共同作用下暂停。当细胞受到发育信号或者外界环境的刺激时,正性转录延伸因子P-TEFb进入磷酸化PolⅡ,DSIF及NELF,使PolⅡ从暂停位点释放,转录进入延伸状态。PolⅡ的暂停与释放调控对于基因的快速表达具有重要意义,此过程发生错调会引起多种疾病。然而,对于此过程中的关键性调控因子的研究并不是很清楚,还需要我们进一步的探索。在这里,我们利用ChIP-seq,RNA-seq及生物学分析等方法揭示ALF家族成员AFF1,在调节近启动子位置处PolⅡ的暂停和释放过程中扮演着双重的角色。一方面,AFF1而非另一ALF家族蛋白AFF4作为超级延伸复合物SEC的组分之一时,促进高表达基因上PolⅡ从暂停位点的释放。另一方面,AFF1和TRIM28共同结合在增强子上阻碍SEC在附近基因上的结合,进而抑制PolⅡ的释放。因此,我们的数据揭示了AFF1和不同的蛋白结合在一起时发挥着不同的转录调控功能。一种是依赖于SEC的经典转录激活模式,另一种是通过增强子抑制Pol II释放的非经典模式,这在转录调控的研究过程中具有新颖且重要的意义。
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