随着时代变迁,新时代民办高校基层党组织建设面临新的环境,虽然民办高校基层党组织建设取得了一些成果,但在实践中,依然存在一些学校党委政治核心作用不充分、院系党组织党建业务两张皮、支部战斗堡垒作用难发挥等问题,加强新时代民办高校党组织建设研究,具有现实价值。本文在对民办高校、基层党组织建设、民办高校基层党组织建设基本概念,以及“全面从严治党”理论、院系党组织“五个到位”、习近平新时代基层党组织建设理论阐述基础上,采用文献研究法、定性分析法、实证研究法等方法,围绕现状考察、模型构建、实证研究的思路展开研究。通过现状考察发现,民办高校学校党委的政治核心作用发挥不充分、院系党组织党建与业务融合存在尴尬、基层党支部的战斗堡垒作用难以体现等问题尚存在,具体表现在党委有效监督作用难以发挥和党委自身定位不准,围绕中心有待加强和服务大局尚需深化,教工支部存在形同虚设现象和学生支部党员先锋模范作用不突出等。基于现状考察分析,以“全面从严治党”理论、院系党组织“五个到位”、习近平新时代基层党组织建设理论为理论依据,构建了新时代民办高校基层党组织建设“456”模型。即学校党委充分发挥政治核心作用、领导作用、保证作用及监督作用等“四个作用”,准确定位党委作用;为院系党组织建设,从物理空间及软件内容等两个方面打造学生思政中心、教师思政中心、课程思政中心、学科思政中心、环境思政中心等“五个中心”,加强与教育教学的融合;基层党支部要加强民办高校基层党支部的政治引领、思想引领、组织引领、作风引领、纪律引领、制度引领等“六个引领”,以充分发挥基层党支部的战斗堡垒作用。以SR民办高校为实践对象,对新时代民办高校基层党组织建设“456”模型展开实践,其效果显示,学校党委政治核心作用得以充分发挥;以SR学校E院系党组织为例,院系党组织党建与业务融合协调发展,“五个中心”激活了院系教育事业发展源动力;以SR民办高校ZY支部为例,在“六个引领”党支部党建工作机制推进下,支部活力增强,业绩提升。