区域产业结构优化一直是区域经济学研究的重要课题,也是我国工业化过程中的热点课题。作为一个后起的发展中国家,我国正处在体制转轨和经济快速发展的时期,结构性矛盾始终是一个基本的制约因素。在国际金融危机和国内资源环境矛盾日益尖锐的情况下,优化产业结构更是促进区域经济又好又快发展的重要途径。然而,区域产业结构优化是一个十分复杂的问题,不仅要考虑产业层面的因素,更要考虑区域资源环境承载能力和功能定位。因此,国家“十一五”规划纲要提出要根据不同区域的资源环境承载能力、现有开发密度和发展潜力构建优化开发、重点开发、限制开发和禁止开发四类主体功能区。这为优化区域产业结构提供了一个新的思路。本文根据主体功能区建设对区域产业结构优化的影响,以四川省为例,从产业综合发展水平、产业结构合理化水平、产业结构高度化水平、集聚化水平等方面对四川产业结构的整体现状以及各主体功能区产业结构的现状进行了分析。分析结果显示,目前区域内的产业结构存在产业发展与区域主体功能定位不符、产业结构低度化、产业能耗水平高以及产业专业化、集聚化水平较低等问题。为此,本文认为需根据四川省各主体功能区的功能定位,实施差异化的产业结构优化战略。我们认为,四川省优化开发区要提升产业层次,集中发展高附加值、低耗能、低污染的新兴工业,大力发展现代服务业和现代农业并完成与区域主体功能定位不符产业的转移；重点开发区要壮大产业发展规模,促进产业集群发展,加快优势农业工业化进程,促进第三产业发展并有选择的承接发达区域的产业转移；限制开发区则在坚持保护优先、适度开发和点状发展的原则下,适度发展特色产业；禁止开发区要把生态功能放在第一位,严格控制产业活动。同时,为了使各主体功能区产业结构优化战略得到有效实施,除了市场调节之外,我们认为还必须依靠科学的、分类的区域政策加以指导。