股权结构对企业的效率影响研究一直是金融学研究的重要内容，而农民专业合作社作为一种农产品生产服务销售的民间互助性经济组织，近年来其企业性质也越来越明显，然而股权结构与农民专业合作社效率的关系却一直无法直接定论。本文希望通过实证研究来探索股权如何影响农民专业合作社效率，并为合作社的发展提供一定的理论参考。　　本文按照农民专业合作社发展的多维目标，将合作社效率区分为经济效率、社会效率和交易效率。在此基础上，本文首先构建了DEA与SFA相结合的三阶段DEA模型，对2014年安徽省299家合作社在剔除了环境变量和随机误差影响后的技术效率进行测度，并利用Tobit模型分析了合作社效率的各项影响因素。实证结果显示，农民专业合作社的经济效率、社会效率和交易效率水平都总体偏低，且社会效率水平最低。同时结论也表明，股权安排对三种效率均有一定的影响。　　其次，本文在研究各学者理论成果的基础上，将合作社的股权结构用股权集中度和股权制衡度来衡量，再建立多元回归模型，分别检验两者与合作社经济效率、社会效率以及交易效率之间关系。研究显示，股权集中度对合作社经济效率有正向影响，但股权制衡度与合作社经济效率显现出的是负相关关系。股权集中度和股权制衡度对合作社社会效率的影响呈现正相关关系。股权制衡度与合作社交易效率是正相关关系。　　最后文章着重从股权结构的角度，对如何提高合作社效率展开讨论。文章认为合作社发展应从实际需求出发，针对具体的效率目标，合理搭配各项措施，进行效率改进。