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马六甲肉食螨Cheyletus malaccensis Oudemans隶属于蜱螨亚纲Acari、肉食螨科Cheyletidae,是捕食性螨类,能捕食粉螨、叶螨、瘿螨及蚧壳虫等小型动物,大多栖息于储粮与中药材中,是世界性分布且具有重要经济价值的动物种类。本研究立足于马六甲肉食螨在我国主要分布的11个省(市)20个地区,广泛采集样本,以mtDNA COI和12S rRNA作为分子标记进行系统发育分析,探讨影响其分子系统地理结构的因素,为储藏物害螨的控制提供理论基础。主要结论如下:(1)本研究结果所得的马六甲肉食螨线粒体COI序列和12S rRNA序列的碱基组成的平均含量都具有明显的A+T偏向性,COI序列片段一共有709bp,碱基中有70个变异位点,共定义了 50种单倍型,单倍型比例为19.53%,总体的单倍型多样性(Hd)为0.9405,单倍型多样性范围为0.378～1.000;核苷酸多样性(pi)为0.01959,单个种群核苷酸多样性范围为0.094～2.633%。12SrRNA序列片段长度约为390bp,碱基中有91个变异位点,总体的单倍型多样性(Hd)为0.8924,单倍型多样性范围为0.600～1.000;核苷酸多样性(pi)为0.10457,单个种群核苷酸多样性范围为0.928～13.608%。两个序列的遗传分化都较高。(2)COI序列单倍型网络图与单倍型系统发育树分为三大分枝,12S rRNA则分为两大分枝。其中COI序列的三大分枝中,A分枝含有157个个体,分属于32个地理种群的24种单倍型,B分枝含有78个个体,分属于30个地理种群的23种单倍型,C枝含有21个个体,分属于7个地理种群的3个单倍型。12S rRNA序列的两大分枝中,A分枝含有43个个体,分属于19个地理种群的4种单倍型,B分枝含有54个个体,分属于21个地理种群的5种单倍型。结果表明单倍型的系统发育结构与其地理分布没有明显相关性。个体的系统发育树显示出了同样的结果。种群遗传距离系统发育树显示地理种群的遗传分化没有明显的地域特点。(3)种群的遗传距离与种群之间的遗传分化都显示各地理种群之间没有显著的规律。对COI和12SrRNA序列进行的中性检验结果显示差异不显著,说明大多数地理种群未发生种群扩张现象。而COI序列的AMOVA分析结果为种群之间的遗传变异占总变异的22.24%,而种群内部的遗传变异占总变异的77.76%;12S rRNA序列的AMOVA分析结果为种群之间的遗传变异占总变异的7.08%,而种群内部的遗传变异占总变异的92.92%,这表明遗传变异主要发生在地理种群内部,种群之间的遗传距离相对较小。两个序列的空间遗传结构分析都表明地理种群间的空间地理距离与遗传距离之间没有显著的相关性。以上结果都显示出马六甲肉食螨没有显示出显著的系统地理结构。第四纪冰期以来,气候和地理环境发生了剧烈的变化导致了分子标记序列的系统发育树显现出清晰的遗传结构。但人类的粮食生产贸易活动促进了不同地理区域的马六甲肉食螨群体之间的基因交流,从而形成了目前这种不同地理种群个体之间相互交错的个体系统发育结构。因此,马六甲肉食螨很可能是由于受到长期的自然历史地理环境与近期人为干扰影响才形成本研究中所得的系统地理结构。