本文基于2000-2013年中国工业企业数据库、中国海关进出口贸易数据库、中国专利数据库以及WTO、Romalis整理的美国进口关税数据,从微观企业的视角探究了贸易政策不确定性（TPU）对中国出口企业自主创新能力的影响及作用机制,并从不同所有制、贸易方式等异质性角度进行了研究。本文主要借鉴Melitz＆Ottaviano（2008）和Antoniades（2015）构建的理论模型,推导得出贸易政策不确定性的降低显著促进企业自主创新能力。在理论分析基础上,本文进行了实证分析,根据实证结果我们发现:整体来说,贸易政策不确定性的下降对企业自主创新能力具有显著正向效应。行业内企业竞争强度、企业技术分布对贸易政策不确定性影响出口企业自主创新行为具有调节效应。行业内企业竞争强度呈现“U”型调节效应:面对国外市场的竞争时,本土企业为了更好地在竞争中生存,会选择更积极的研发投资行为来促进企业创新;然而随着竞争的不断深入,行业内的企业没有更多的创新资源,最终会抑制企业创新行为。当行业内企业技术水平相当时,企业之间良性的竞争会提高企业的创新能力;然而行业内企业之间技术分布悬殊时,技术落后的企业即使加大创新也很难获得利润,这时企业就没有创新的动机。影响机制表明,企业在贸易政策不确定性降低过程中将通过创新投入决策、“出口中学习”效应和市场效应来促进企业自主创新能力,并通过双重差分法（DID）进一步验证了两者的正向关系。此外,贸易政策不确定性的降低对企业自主创新的影响具有显著的差异性,这取决于企业所有制类型、贸易类型、技术水平和企业所在地的具体分布。基于理论推断和实证研究分析,本文提出如下几点政策建议:第一、在中美贸易摩擦的背景下,贸易政策不确定性不断增加,各国应该继续沿着贸易自由化道路前进,致力于通过签署一系列自由贸易协定来有效降低其不确定性。第二、政府应该更多关注支持民营企业的发展,给予民营企业更多的财政支持,与企业保持良好的沟通和交流,提高企业的自主创新能力,以更好地面对未来贸易政策不确定性的变动。第三、作为一个以盈利为最终目标的企业,如果企业想在有限的市场长足发展,就必须开拓创新并使其经营多元化。资本积累增加,技术创新投资的外部融资需求降低,有利于企业的创新活动。