为了开发新型表达序列标签微卫星(EST-SSR)标记，筛选获得多态性丰富同时与性状连锁的标记位点，并以之为基础建立动物基因聚合分析预测方法，选出适于多基因聚合的最佳基因型类群，本研究收集下载绵羊特定组织表达序列标签设计开发新型EST-SSR标记，并结合关联性分析结果获得与性状连锁的EST-SSR标记位点，通过电子PCR技术将之定位于特定染色体上，同时完成原始EST的功能注释，明确标记位点可能的生物功能；分析位点间连锁关系，选择独立遗传位点，基于基因型均值聚类分析建立动物基因聚合预测方法，最终筛选出针对特定性状的最佳基因型聚合类群，具体结果如下：
　　1．开发获得了17对多态性丰富的绵羊EST-SSR标记位点，结合毛性状与繁殖性状进行的关联性分析进一步筛选出12个对目标性状有遗传效应的位点。
　　2．利用电子定位技术将16个多态位点定位于牛的13个染色体上，通过牛、羊染色体同源性分析最终将位点定位于绵羊染色体上，并对其中9个位点原始EST进行了功能注释，初步明确了标记可能的生物功能。
　　3．分析计算了标记间r2与D’值，结果显示12个位点间连锁程度较低，属于独立遗传，可用于基因聚合分析。以位点的基因型均值聚类结果进行了分群比较，获得了针对毛性状、繁殖性状不同指标的7个聚合类群及其相应最佳基因型组合。
　　本研究结果表明，基于EST开发微卫星标记效率较高，多态性丰富，而且整体上对性状具有较高的遗传效应；利用电子PCR技术可以对EST-SSR标记进行染色体初步定位及功能注释，可进一步分析验证标记功能；以位点基因型均值相似系数为基础的聚类分析可有效将位点不同基因型进行分类，参考类群性状表现获得的最佳聚合基因型类群对基因聚合育种计划的制定具有指导意义。