花生是世界重要的油料作物、经济作物和优质蛋白质作物之一，在北纬40°到南纬40°的100多个国家广泛种植。主要分布于亚洲、非洲及南美洲等发展中国家。中国在世界花生生产和贸易中占有极为重要的地位，总产量居世界首位，面积仅次于印度，单产仅次于美国。花生叶斑病是世界范围内分布最广泛、为害最严重的花生病害之一。花生叶斑病分为早斑病和晚斑病两种，在我国又分别被称为褐斑病和黑斑病。川渝花生产区是我国花生主产区之一，是我国西部最大的花生产区，但该区域内花生品种改良研究基础相对薄弱，尤其种质资源和育种新技术缺乏系统研究和应用，限制了花生育种后劲及高产优质专用多抗品种选育的突破。 本研究以抗感晚斑病组合“中花5号×ICGV 86699”的F₂分离群体为材料，经田间抗性鉴定明确抗性亲本ICGV 86699的抗性受隐性单基因或主效基因控制：以AFLP分析结合BSA法筛选到与晚斑病抗性连锁较紧密的AFLP标记3个，即E35／M51、E37／M48和E41／M47，它们与抗性间的图距分别为7.40cM、7.40cM和8.67cM；所获得的3个标记间连锁紧密，位于同一连锁群上，其中与抗性连锁最紧密的标记E35／M551和E37／M48更具育种辅助选择的实用价值。这3个标记在具有野生种亲缘的7个抗病花生品种或材料中均能检测到，而在栽培种以多粒型为代表的抗病材料中均未检测到，表明ICGV 86699的抗性基因与栽培种花生中的抗性基因不同。这是国内外有关花生晚斑病抗性分子标记的首例报道。 本研究将AFLP技术与表型分析相结合，分析了来自川渝地区的43份主要花生种质资源和推广品种的遗传多样性。结果表明，AFLP技术能有效地检测来自同一生态区内的栽培种花生间的遗传多样性，龙生型、普通型和中间型品系归属于类群Ⅰ，该类又可分为两个亚类ⅰ和ⅱ，前者以龙生型和普通型为主，后者以中间型为主，而珍珠豆型品系自成一类（类群Ⅱ）。龙生型的外贸加工型主要推广品种南充混选1号和天府5号归属于类群Ⅰ的亚类ⅰ，而中间型高产品种归属于亚类ⅱ。出苗期、初花期、侧枝长、单株分枝数、单株饱果数、单株果重、百仁重和出仁率等8个性状的系统聚类分析表明，83S4-44（类群Ⅱ）和845-185（类群Ⅳ）各自单独成一类，其余41个品系分为三大类群。四个类型的品系在这三大类群间有所交叉，但类群Ⅰ的亚类ⅰ为珍珠豆型地方种，亚类ⅱ以龙生型和普通型为主；类群Ⅲ以中间型为主，其中亚类ⅲ又较亚类ⅳ育成年代更早或亲缘关系更近；类群ⅴ仅包括龙生型和普通型品系，且大多为地方种质。 AFLP与表型两种分析方法聚类结果基本一致，珍珠豆型和龙生型内品种间距离较小，而普通型和中间型内品种间距离较大；交替开花亚种的龙生型和普通型品系关系最近，而连续开花亚种的珍珠豆型与交替开花亚种的普通型间关系最远；主要推广品种间的遗传多样性匮乏。AFLP技术能更好地将珍珠豆型与其他类型区分开来，再将连续开花的中间型与交替开花亚种的龙生型和普通型区分开来；而表型聚类难于将四大类型明确区分开，但能较好地解释更细微的形态和年代差异及亲缘关系。该区域内的花生种质和推广品种的主要性状差异较小，品种间主要性状趋同，缺乏适应不同需求的专用型品种。在花生育种上，应注重地方种质的发掘和创新，同时注重外源种质的引进和利用，以丰富本区域栽培花生的遗传基础。