随着市场经济的发展,以提供虚假材料为由要求撤销公司设立登记或者法定代表人变更、股东身份等登记事项的案件已经不是个案问题,对于采取何种方式解决此类行政问题存在争议,这类问题裁判不统一已经成为短时期之内无法避免的问题。之所以出现这样的局面,是因为人民法院在权衡这类问题时,既要考虑直接牵扯到登记载明的法定代表人、股东的个人财产申报,社会保障待遇以及受害人另行开办公司等权益,又要考虑到公司主体资格消灭、股东身份责任免除等给社会带来的债权人维权、税收征管发生障碍等公司的法人责任承担问题。在既避免公司未经清算就被撤销、股东不会因为撤销或变更登记逃避责任,又不让“被登记”的公民合法权益免受损害,是现有制度处理公司登记案件的难题。论文选取三则案例,剖析工商机关的登记审查原则、撤销公司设立登记的司法介入机制及公司注销后的税收债权追缴问题,动态的展现了公司瑕疵设立和撤销公司设立登记退出市场经济的完整过程。以行政管制与经济自由为思想指导,权衡政府权力与民商经济发展的平衡。在此基础上,提出应构建出与行政诉讼并行的民事诉讼救济模式,解决公司设立登记撤销及其遗留社会法律关系问题。