基于结构的HIV-1整合酶链转移抑制剂的虚拟筛选

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整合酶是Ⅰ型人类免疫缺陷病毒(HIV-Ⅰ)完整的生命周期不可或缺的催化酶之一。整合酶可以将逆转录酶产生的病毒DNA整合到宿主染色体中,从而帮助HIV-Ⅰ完成生活周期。以整合酶为靶点的抗艾滋病制剂的研究是最近几年来的热点。  传统中草药具有结构多样性、低副作用的特点,已发现多种成分具有抗HIV活性,但是存在机制不清、靶点不明的缺点;迄今为止,完整的整合酶晶体结构或者整合酶与病毒DNA复合物的晶体结构仍然没有被解析。本研究通过同源模建构建处于链转移抑制状态的IN-vDNA-RAL复合物。然后利用该复合物产生基于受体-配体复合物的药效团模型。用产生的药效团模型对传统中草药数据库进行筛选,将筛选得到的化合物与构建的处于抑制状态的IN-vDNA复合物进行分子对接,得到11个结合自由能打分高于RAL药物的化合物。  在这11个天然化合物中,2个化合物有实验数据证实具有体外抗HIV活性,另外9个属于新型的小分子,具有潜在的整合酶链转移抑制活性。
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