随着计划经济向市场经济的转变,我国处在利益分化的社会转型时期,我国的利益关系出现了利益主体多元化、利益表达公开化、利益差别扩大化、利益关系复杂化和利益主体权利失衡的局面,在这样的背景下,社会不同的利益主体既存在因为分化与重组而产生的矛盾与冲突,还会在政治系统和社会系统中重新寻求依托来表达自己的利益诉求。利益相关者理论通过分析不同利益相关者的利益诉求,找出造成利益冲突的深层次原因,从而提出解决利益冲突的思路和方法。利益相关者理论是一种对公共政策中的利益进行分析而且颇有成效的分析方法,本文选择以太湖水污染防治政策为例。太湖水污染的问题日益突出,2007年太湖蓝藻暴发事件,彰显出现有的太湖水污染防治体制存在很多问题。面对太湖水污染主体的多元化和越来越复杂的治理环境,传统的以政府为中心的治理方式陷入困境,在实践中,各级政府就太湖水污染防治达成双赢或共赢的实际成功案例很少。太湖流域公共问题的复杂性决定了治理方式由传统的地方治理走向多元主体的合作治理,不同的多元主体意味着有不同的利益诉求,如何达成合作,减少利益冲突,成为本文研究的基本问题。利益相关者理论能够为我们理解多元主体间的关系结构提供依据。文章中借用利益相关者理论的思想和方法,发现太湖水污染防治中存在中央政府、地方政府、企业和公众等核心利益相关者,不仅分析了单个利益相关者的利益诉求,而且探究了他们之间的关系,并相应的分析了利益相关者合作治理的基本要求和面临的困境：价值目标不一致、多元主体责任不明确、多元主体行动难统一,最后提出完善利益相关者合作治理机制的一些建议,分别是建立合理的责任共担机制、建立多元参与的治理机制、建立合作治理的激励机制、建立合作治理的监督机制、完善利益共享和补偿机制、树立合作治理的文化意识。