十九届五中全会提出,要坚持科技自立自强,利用科技创新驱动发展,全面塑造发展新优势。在如今双循环经济大背景下,福建省要想畅通经济循环,实现经济跨越性发展,必须全面推动科技进步,不断提升自主创新能力。而科技的发展,技术的创新,需要连续充足的科研经费作保障,除了企业自有资金投入之外也需要政府财政的大力支持。合理评价福建省财政科技支出效率,不仅可以优化政府对科技资源的配置,还有利于形成强大的乘数效应,驱动形成高质量发展的经济新增长极,为福建省新发展格局的构建注入活力。本文先对国内外已有研究成果进行梳理和总结,并立足福建省政府科技投入产出现状,发现其存在的问题:首先,政府资源配置存在区域失衡和项目失衡问题。九地市科技经费投入两极分化引致“马太效应”,且轻基础研究,重试验发展,从源头上忽视原始创新能力的培育。其次,全省科技人力资源投入总体不足,科技研发活动缺乏稳健且强有劲的智力支撑。最后,福建省在科技直接产出、科技成果转化、科技经济效益以及科技环境保护上均存在一定产出不足。基于现状分析,本文分别从省级和地市级两个层面,运用DEA方法,实证测算政府科技支出效率,对造成效率差异的影响因素提出假说,运用Tobit模型定量分析加以验证,并基于双循环新发展格局,定性分析可能对效率造成影响的新因素。研究发现:一,财政科技支出综合效率低下,且地区差异较大,主要是财政科技投入规模不合理造成的;二,财政科技投入产出结构不匹配,部分地市投入的冗余造成财政资源和科技人才资源的浪费,产出的不足体现了科技转化率低;三,经济发展水平、受教育水平、地区开放度、产业现代化水平以及政策支持力度能正向促进财政科技支出效率的提升,而政府规模具有反向抑制作用;四,在双循环经济下,优化升级产业结构、市场化配置要素、开展高水平对外合作以及大力推进知识产权保护都将进一步正向影响福建省财政科技支出的水平。针对以上现状分析以及实证结果,结合双循环新经济环境,本文从优化财政科技支出、提高科技产出以及加强财政科技支出有效监管三方面,设计出福建省财政科技支出效率提升的新路径,以期加快福建省科技创新进程,为其他地区政府科技支出管理起一个示范性作用。