Mucilaginibacter hurinus ZR32T的分类鉴定与基因组分析

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微生物极广泛地分布在地球上,微生物不仅仅在自然界中,同时也在人类生产活动中扮演着极其重要的角色,然而我们目前为止所认识的微生物仅仅为其中很小一部分。分离培养及多相分类学鉴定自然环境中的各种微生物,可以丰富微生物资源库,对实际应用有很重要的意义。这对实际应用有很重要的意义。功能性微生态系统作为一种分解剂具有很高的效率,有助于解决环境问题。如果我们能够准确地理解微生物的价值,并根据需要使用它们,我们就能够解决我们面临的环境问题。本研究从韩国蔚山广域市蔚州郡煤炭库前面的土壤中分离得到42株菌,通过比对16S rRNA基因序列完成初步鉴定,包含芽胞杆菌属,克氏考克菌属,假单胞菌属和梭状冻胶样杆菌属等13个属,其中芽胞杆菌属菌株所占比例最大。根据16S rRNA基因序列的相似性判断,ZR32T菌株可能是梭状冻胶样杆菌属的一个新种。以梭状冻胶样杆菌属的相关菌株Mucilaginibacter soli R9-65T和Mucilaginibacter gynuensis YC7003T为参考菌株对ZR32T进行了多相分类学鉴定。ZR32T菌株,在R2A培养基中菌落为粉红色。其细胞为杆状,革兰氏阴性,好氧,没有运动性。对ZR32T进行16S rRNA基因序列比对发现该菌株与Mucilaginibacter soli R9-65T(97.0%),Mucilaginibacter gynuensis YC7003T(96.9%),和Mucilaginibacter lutimaris BR-3T(96.8%)。在Neighbour-Joining algorithm(NJ tree),Maximum-Likelihood(ML tree)and Maximum-Parsimony(MP tree)系统进化树分析显示细菌ZR32T只与Mucilaginibacter soli R9-65T稳定的聚在一起。DNA G+C mol%含量是为43.0 mol%,在梭状冻胶样杆菌属G+C mol%含量(31.1-42.8 mol%)范围内。ZR32T与两个菌株M.soli R9-65T和M.gynuensis YC70003T的DNA-DNA杂交结果分别为31.2±6.9%和19.7±0.3%,均低于70%表明菌株ZR32T可能是梭状冻胶样杆菌属的一个新种。ZR32T对Na Cl生长范围为0-1%,生长温度范围为4-28℃,生长pH范围为6-10,主要脂肪酸(>5%)为summed feature 3(C16:1ω6c and/or C16:1ω7c),C16:0,C16:1ω5c,iso-C15:0,iso-C17:0 3-OH和C17:1ω9c,主要极性脂为磷脂酰乙醇胺,未知的磷脂,未知的鞘脂和未知的极性脂质,主要的呼吸醌为MK-7。基因组草图测序及基因组注释显示,其基因组大小为3,881,846 bp,含有3,347个蛋白质编码基因,39个t RNA编码基因,5个rRNA编码基因以及82个重金属抗性相关的基因,其中与锌抗性相关的基因有40个。菌株ZR32T的基因型特征、形态特征、生理生化特征和化学分类学特征分析结果表明,ZR32T既具有梭状冻胶样杆菌属的属内特征,又与参考菌株存在种间差异。此外,在基因组分析中,发现了与多个重金属抗性相关的蛋白,表明ZR32T具有潜在的微生物资源利用价值。而且,本研究丰富了梭状冻胶样杆菌属的多样性,完善了梭状冻胶样杆菌树的基因组信息,发现了具有改善环境污染潜力的微生物资源。
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