AcrVA5介导的乙酰化和CobB介导的去乙酰化修饰对Cas12a切割活力的可逆调控研究

来源 :上海师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:woshizzh1713
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
CRISPR(clustered regularly interspaced short palindromic repeat)系统是一种被细菌用来抵御外来噬菌体入侵的获得性免疫机制。Cas12a蛋白通过CRISPR RNA(cr RNA)引导特异性靶向入侵的外源基因片段,并切割该片段,从而使细菌不被侵染。由于具备可编程性,和Cas9一样,Cas12a也被开发为多个物种的基因编辑工具。为了降低基因编辑的脱靶率,人们开发了包括anti-CRISPR蛋白在内的多种方法来精准调控Cas蛋白的作用强度和作用时间,以期开发出更安全、更高效、更精确的基因编辑工具。其中,AcrVA5作为乙酰基转移酶便是antiCas12a的蛋白,可乙酰化Cas12a蛋白并使其失活。本课题在AcrVA5可乙酰化修饰失活Cas12a的基础上,进一步证明了AcrVA5的乙酰化修饰受体具有广泛性,并可乙酰化失活多种Cas12a蛋白。通过体外纯化AcrVA5和五种Cas12a蛋白,进行体外乙酰化实验和Cas蛋白的顺式与反式切割实验,证明了AcrVA5能乙酰化修饰降低Lb Cas12a、Mb2Cas12a、As Cas12a、Fn Cas12a、Lb5Cas12a蛋白对靶双链DNA的顺式和反式切割活性。此外,还证明了AcrVA5具有广谱乙酰基转移酶活性,且CobB蛋白能去乙酰化修饰大部分被AcrVA5失活的蛋白,如Lb Cas12a、Mb2Cas12a、As Cas12a和Fn Cas12a,并恢复其顺式和反式切割活性。然而,CobB蛋白不能恢复被AcrVA5失活的Lb5Cas12a,其机制有待探寻。之前研究报道AcrVA5通过乙酰化修饰Lb Cas12a的Lys613位点,使其乙酰化后并失去识别PAM位点的能力。然而,本课题发现Lb Cas12a的Lys613突变为精氨酸后仍然能够被AcrVA5介导的乙酰化修饰失活,因此推测PAM序列区含有不止一个关键氨基酸位点参与了Cas蛋白对靶标DNA的识别。本课题通过对AcrVA5和CobB蛋白可逆修饰Cas12a的研究,加深了对CRISPR和anti-CRISPR作用机制以及细菌和噬菌体共进化机制的理解,并有助于将来开发更好的基因编辑工具。
其他文献
我国正稳步实现创新驱动发展的战略目标,但市场机制的欠完备性使企业创新行为受到阻碍。在关于经济增长和波动的研究范畴中,已证明研发投资会受经济波动与外部需求冲击的影响
舟山群岛是中国最大的沿海群岛,是全国第一个以群岛设市的地级行政区划,共有岛屿1390个,陆域面积1440.2平方千米,位于我国东海海域,在东经121°30’~123°25’,北纬29°32’~31
会计师事务所与审计师作为监督上市公司会计信息正常披露的第三方,在降低信息不对称程度、维护市场公平、提高经济运转效率上发挥着不可替代的作用。然而作为第三方的会计师事务所在审计业务这个“买方市场”里不免会有听从客户安排的行为,上市公司出于各种原因可以选择新的审计主体完成审计业务,并且我国审计市场的激烈竞争现状也为上市公司变更审计主体提供了便利。然而无论是追求审计意见改良、获得满意的审计服务、审计费用的
非线性偏微分方程组在科学工程中的应用十分广泛,其数值方法的研究越来越受到学者们的关注.本文受已有数值算法的启发,研究求解一类偏微分系统多解问题的数值计算高精度算法,偏微分系统具体形式如下:(?)其中Ω=[-1,1]×[-1,1],γ,λ,δ,κ是给定的参数,且满足δ>0,γ≤λ.当a(x)=0时,方程组具有变分结构,数值求解已有多种成熟算法.当a(x)≠0时,方程组不具有变分结构,与能量有关
光不仅可以为植物的光合作用提供能量,同时也作为一种重要的环境信号来调控植物的生长发育。为了更好地适应环境,植物进化出多种光受体来感受环境中不同种类的光。光敏素(phytochrome B,phy B)是最主要的红光受体,在红光照射下,phy B能从细胞质转移到细胞核中。细胞核中的phy B一方面与光形态建成的关键负调控因子COP1和SPA1互作,抑制该复合物的活性,促进光形态建成正调控因子比如HY
党的十九大以来,无论在经济上还是在生态、环境、人文方面我国整体都有了很大的提高,正逐渐转向高质量发展,取得的成就也备受瞩目。但当下区域协调发展还存在问题,整体上还处于不均衡不稳定的状态,各区域发展两极化现象严峻,西北、东北地区相比中部地区差距还十分明显,彼此间的恶性竞争仍存在。在区域协调发展的测度、发展水平的时空特征以及动力因素等方面缺乏详细的阐述,因此有必要进行研究,充分发挥互联网、资本等的积极
PROS公司是一家从事跨国化工贸易的韩国企业,主营以氟化物产品为主的化工原料贸易。公司2011年设立上海子公司,借力于中韩贸易的快速增长企业得到了飞速发展。但由于文化背景
株高是影响作物结构、根尖优势、生物量、抗倒伏、耐拥挤和田间收获的重要因素。在第一次“绿色革命”期间,为了使灌溉和高肥料利用率下的产量最大化,利用半矮杆基因sd1培育半矮化水稻品种减少倒伏并提高田间收获率。水稻植株高度是由基因控制的,这些基因位于一个复杂的调控网络中,目前通过反向遗传学和图位克隆已经鉴定出约30多个控制植物高度的基因,主要参与植物激素的生物合成或信号转导。研究发现赤霉素(GAs),油
应有文写作教学在中职语文教学占有重要地位,而中职学生对应用文写作兴趣不高,与中职常用应用文在教材内容分布不够合理、教学方式单一、教学学时受限等方面存在的问题有关。本文通过任务型教学改变传统应用文写作教学模式,开展真实的任务型教学,强调以学生为中心,“在做中学,在用中学”的理念,从学生的学习生活和未来职业发展的需要出发,把培养学生具备完成任务的能力作为教学目标,以目标为导向,以具体任务活动实施为阶梯
细菌感染引起越来越多的医疗和公众关注。随着人类预期寿命的不断延长,易受细菌感染的人数也在增加。更复杂的是,目前的抗微生物疗法面临着无处不在的耐药微生物(如耐氧西林金黄色葡萄球菌)的挑战。耐药菌引发的感染发生频率高,且难以诊断和治疗。目前,传统的细菌检测方法,如培养基培养技术、酶联免疫吸附试验(ELISA)和聚合酶链反应(PCR)分析等耗时长,而且缺乏足够的分辨率和实用性,不能明确区分细菌感染,更不