跨区域调水工程在调剂水量余缺以实现水资源合理开发利用与合理配置方面发挥着重要作用,是解决水资源时空分布不均、缓解经济增长水资源制约的最科学、最有效的途径之一。南水北调中线工程是国家实施跨区域水资源调配的重大工程,该工程的建设不但可缓解京、津及华北地区的水资源危机,还将会大大改善受水区及沿线地区的生态环境和投资环境,推动我国中北部地区的经济发展,促进区域间协调发展,因此该工程的建设具有重大的战略意义。丹江口水库作为南水北调中线工程的水源地,其水质的好坏直接影响到受水区居民生活和受水区的经济建设。而南水北调工程客观上需要水源地提供优质水源,这不仅需要投入大量资金用于生态保护和建设,还会限制甚至禁止相关企业的发展,增加了当地经济社会发展的机会成本。由于生态资源本身的外部性、公共品属性以及目前生态补偿机制不够完善的局面决定了环境利益和与之伴随的经济利益在保护者、受益者、破坏者之间分配不公平,受益者无需付出较高的成本有的甚至无偿享受生态服务,生态服务供给者得不到相应的补偿,生态环境破坏者也无需付出相应的成本。这不仅会影响水源区进行生态建设的积极性,还会扩大区域经济社会发展差距。为了实现区域协调发展,必须扭转和调整这种利益分配格局,构建完善的生态补偿机制。鉴于此,本文重点研究南水北调中线水源区丹江口水库生态补偿机制的构建。在生态补偿机制构建中,首先明确补偿主体与补偿客体,其次确定生态补偿数额,最后以政府补偿和市场补偿两条主线构建补偿机制。在补偿数额方面,根据生态服务价值法和成本法分别计算出生态补偿数额,利用综合平均法计算出最终的补偿额度,然后根据受水区的人均财政收支计算出财力系数,以此确定每个区域所应该承担的补偿数额。补偿方式上,针对政府补偿和市场补偿两种不同的运行机制分别构建相应的补偿模式。其中,政府补偿主要通过财政转移支付手段进行补偿,并计算出纵向转移支付补偿数额和以基金为载体的横向转移支付补偿数额,市场补偿则主要是在明晰水权基础上探索如何通过水权拍卖机制在水权交易市场上实现生态补偿。