医疗保障是中国社会保障体系构建的重要方面。发展我国农村医疗保障事业是协调社会各群体利益关系和解决社会矛盾冲突的现实需要,同时也是构建和谐社会、全面建设小康社会的必要手段。党的十七大报告提出“加快推进以改善民生为重点的社会建设”,民生建设应以人们日常最迫切需要解决的问题为主。在中国农村,“因病致贫、因病返贫”问题是农民最迫切需要解决的关乎自身生存的现实问题。农村新型合作医疗制度就是我国针对农民健康医疗保障需求而提出的一项惠民政策,它不但是破解“三农问题”的钥匙,而且还在构建和谐社会中起着不可替代的作用。在我国现阶段,农村新型合作医疗制度存在着价值理念偏颇,规则、组织、设施系统缺位等问题,这不但不利于我国农村居民健康水平的提高,而且还制约着我国社会主义新农村建设和和谐社会构建。因此,寻求农村新型合作医疗制度运行困境的对策,深入分析农村新型合作医疗制度的执行状况,剖析制度运行障碍的原因,对制度自身建设、制度文明的形成以及社会的有效整合意义重大。本研究主要采取定性研究与定量研究相结合的研究方法,基于“吉林省百村老年人生产状况调查”,在对农村新型合作医疗制度执行状况进行系统调查研究的同时,对农村新型合作医疗进行社会学意义上的制度分析,讨论目前农村新型合作医疗制度的运行困境,并分析制度运行存在障碍的原因,从而探讨我国农村新型合作医疗制度选择的出路。