褐飞虱是一种毁灭性的水稻害虫，主要通过吸食水稻茎叶组织汁液为害，严重时引起水稻倒伏，导致大面积减产或失收。昆虫丝氨酸蛋白酶基因具有消化、发育及防御等多种生理功能，研究褐飞虱的丝氨酸蛋白酶对防治褐飞虱具有重要意义。目前褐飞虱的全基因测序已经完成，大量的基因组及转录组信息为研究基因功能提供了便利。本文鉴定了构成褐飞虱丝氨酸蛋白酶基因家族中的丝氨酸和丝氨酸蛋白酶同系物，并根据全基因组测序结果分析了基因结构，揭示了基因的进化关系。根据褐飞虱基因组和转录组测序信息，预测了90条丝氨酸蛋白酶家族基因，其中65条为丝氨酸蛋白酶，25条为丝氨酸蛋白酶同系物;详细分析褐飞虱丝氨酸蛋白酶基因家族的外显子-内含子区域、基因长度、基因分布和转录方向;褐飞虱许多丝氨酸蛋白酶基因位于同一scaffold的相邻位置，表明此基因家族基因的复制频繁发生。基因表达模式的研究揭示了褐飞虱丝氨酸蛋白酶对细菌感染的应答反应，揭示了丝氨酸蛋白酶基因在不同组织、不同发育阶段和雌雄虫中的表达差异。