泌尿生殖道感染主要病原体检测基因芯片的构建及临床初步应用

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:thriving_hehe
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的80年代以来,性传播疾病(sexually transmitted diseases,STD)发病率日趋上升,其中淋菌性尿道炎(gonococcal urethritis)和非淋菌性尿道炎(nongonococcalurethritis,NGU)发病率较高,前者由淋病奈瑟菌(Neisseria gonorrhoeae,Ng)感染引起,而后者主要由解脲脲原体(Ureaplasma urealyticum,Uu)、人型支原体(Mycoplasma hominis,Mh)等感染引起。由于引起泌尿生殖道感染的病原体复杂、多样,为临床治疗带来困难,因此迫切需要寻求一种特异性强、敏感性高同时又快速、经济的病原学检测方法,为临床病原学治疗提供实验依据。目前临床用于泌尿生殖道感染病原体检测的方法有培养技术、免疫技术和PCR技术等。这些技术在临床诊断中已发挥了巨大的作用,但仍存在一些缺点。培养技术繁琐而费时;免疫技术要有特异的抗血清。PCR技术本身的优越性是无可厚非的,但是使用不当很容易引起交叉污染,出现假阳性;如果反应条件控制不好也可能出现假阴性。这些缺点需要应用新的技术去弥补。近几年发展起来的基因芯片技术为泌尿生殖道感染的病原学诊断提供了一种强有力的手段。其快速、高效、高通量、并行化的检测特点在病原学诊断方面具有独特的优势。基因芯片技术在病原学诊断上的应用研究虽已取得很大进展,但目前尚无成熟的泌尿生殖道感染病原体检测基因芯片应用于临床,且我国学者在这方面的研究开展较少。本实验制备了一种可同时检测Ng、Uu和Mh三种病原体的复合基因芯片,以期为临床提供一种高通量、并行化的泌尿生殖道感染病原体的检测方法,并为我国日趋严峻的STD防治工作的改善奠定理论和实验基础。实验材料和方法一、实验材料标准菌株:淋病奈瑟菌ATCC 29106,购于中国药品生物制品检定所;解脲脲原体ATCC 33697,人型支原体ATCC 23114均购于首都儿科研究所。临床标本来自中国医科大学第一附属医院皮肤性病科门诊就诊患者。支原体基础培养基PPLO购于北京泽平生物技术研究所,淋球菌琼脂基础培养基购于中国药品生物制品检定所,Uu和Mh的选择性鉴定固体培养基(二合一培养基)由上海恩康生物科技有限公司友情提供。PCR试剂盒(TaKaRa)引物与探针(上海生工合成)PCR扩增仪(Biometra Personal PCR system,Germany),生物芯片点样仪(MicroGrindⅡ600,Biorobtics Ltd,England),激光共聚焦扫描仪(Gene TACTMLSⅣ,Gnomic Solutions Inc.USA)二、实验方法1、用液体和固体两种培养基培养Uu和Mh两种支原体标准菌株,用固体平板培养基在烛缸内培养Ng标准菌株。2、临床标本采集:用无菌棉拭子取男性尿道女性宫颈分泌物。3、应用生物信息学软件设计通用引物和特异探针,分析其合理性。4、采用酚-氯仿法提取病原体DNA模版。5、不对称PCR制各样品靶序列。6、制备病原体检测芯片:片基处理,按预先设计好的微阵列矩阵使用生物芯片点样议将探针点在芯片上,水化,烘烤固定。7、通过重复杂交、分析测序结果和对比临床回复的结果来检测芯片的重复性和可靠性。结果1、标准菌株在两种培养基中均生长良好,提取模版DNA,PCR扩增目的条带,产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳后银染色,产物条带清晰,长度与理论设计一致。2、探针设计合理,与其它病毒、细菌等无同源性,待检测病原体各探针之间有极高的特异性。3、芯片杂交温度为60℃,反应1h所获得的杂交信号较强。4、芯片杂交结果重复性较好,探针检测重现率97.5%,与门诊回复结果符合率为96%,反馈的测序结果经BLAST软件对比分析,与其芯片检测结果完全一致,验证了芯片的可靠性。结论1、泌尿生殖道病原体检测基因芯片设计合理,检测结果理想。2、该芯片具有较好的重复性和可靠性,为临床泌尿生殖道感染病原体检测新技术的开发提供了实验依据。
其他文献
随着以5G网络建设为首的新型基础设施建设(简称〝新基建〝)政策的提出,属于物联网新型基础设施的智慧灯杆迎来了绝佳的发展时期.介绍了当前我国智慧灯杆的建设发展现状及国家
结核病是由结核分歧杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)引起的慢性感染性疾病,目前仍然是威胁人类健康的主要感染性疾病之一,亦是世界上感染性疾病致死的主要病因。近年来,随
针对水下景观灯的电缆布线复杂、后期维修困难、存在漏电隐患等问题,提出一种基于无线供电的水下LED景观照明系统.采用COMSOL软件建立耦合线圈模型,对不同形状和尺寸的耦合线
为提升板上多芯片集成封装(Chip on Board,COB)LED器件的光品质和可靠性,解决目前封装环节的技术痛点,研究了COB器件的光电热耦合效应,分析了COB封装过程中各个工艺细节.提出
介绍一种新型家用的一氧化碳(CO)报警器的原理与设计。其采用MOTOROLA半导体的MGS1100一氧化碳传感器作为CO敏感元件,辅之温度补偿,由MOTOROLA半导体的MCU68HC05P9进行实时控制和特性修正。文中对CO传感器温度补偿方法、CO浓
期刊
设计了一款新型LED交通信号灯,在规定角度范围内光强分布均匀且直观无明显颗粒感.将高亮度LED出射光用均光透镜等光强分布在菲涅尔透镜平面上,利用菲涅尔双面透镜进行准直,通
传统的探照灯内通常只采用单片抛物面反射镜对光线进行反射.为了提高光源使用率,根据卡塞格林系统原理,通过增加1片球面反射镜对光线进行二次收集,设计了一种组合式反射镜系
随着发光二极管(LED)的广泛应用,基于LED的可见光通信(VLC)技术得到了长足的发展.但可见光系统中接受光功率、光电二极管带宽和传输距离之间存在着普遍的矛盾,为了缓解这种矛
手术无影灯作为二类医疗器械,在注册检验中须根据《医用电气设备第1-2部分:安全通用要求并列标准:电磁兼容要求和试验》标准通过电磁兼容(EMC)测试.目前手术无影灯在电磁兼容