供应链协同管理正成为企业界关注的焦点和学术界研究的热点。本文主要应用系统科学、管理学和经济学等学科领域的相关理论与方法对供应链协同管理进行系统分析与研究。 本文首先概述了供应链协同管理的基本理论和概念，运用交易费用经济学和企业能力理论对供应链协同网络进行了分析。本文认为供应链协同网络是一个处于纯市场和纯科层组织之间的中间组织，是一个由供应链上下游企业组成的企业网络，也是一个基于长期合作与信任的战略联盟。 其次，分析并研究了供应链系统是一个复杂性系统，将协同学的理论引入到供应链协同研究之中，根据供应链剩余的概念，揭示出供应链剩余就是供应链协同系统的序参量，运用协同学的理论和方法建立了基于供应链剩余序参量的协同学分析模型，分析了供应链剩余的演化与发展。 再次，分析了影响供应链剩余的三个系统参量：专业化、信息化和知识管理，论述了它们对供应链剩余的影响，以及它们与供应链剩余相互作用对供应链系统演化与发展的影响；应用平衡记分卡构建了供应链企业绩效的评价体系，提出基于层次分析法的计算方法与步骤，这样就可以通过供应链剩余的计算公式初步计算出供应链剩余；分析了供应链合作的机制，给出了供应链剩余的实现途径，并对供应链剩余的的分配进行了专门的研究和分析。 最后，本文分析了影响供应链协同管理的几个关键问题：信任、核心组织和信息技术，并对文章进行了总结，提出了本研究的不足和展望。