村级集体经济组织是所有村民以生产资料集体所有的形式组成的,实行自负盈亏、独立核算的经济组织。农村集体经济组织积极开展经济活动,不但有助于实现经济效益的提升、科学合理的将经济效益分配给组织成员,而且在对农村财务管理的改善与规范上有着积极意义,最终实现保障集体成员的经济利益、推动社会主义新农村建设的目标。本文基于H区农村集体经济组织财务运行的政府监管研究为切入点,以“委托代理”理论、财务管理内部控制理论和制度变迁理论为依据,并结合国内外学者的相关研究成果,立足于H区农村集体经济组织的现状,运用文献分析、问卷调查、参与式观察等研究方法,重点研究与剖析了H区农村集体经济组织财务运行的政府监管情况,发现其中存在村级财务“内部人”控制现象严重、会计监督职能较弱、公开化的财务信息可靠性低、财务管理不合格、会计核算不规范等诸多问题,并且通过分析,这些问题源于思想存误区、审计力量弱、制度覆盖低、信息不对称、双重代理严重及监管体系未健全等原因,最后针对问题及原因提出了具体的解决对策:健全党组织监督、政府加大扶持、加强财务审计、健全财务制度、确定开支范围、明确委托代理权责以及构建监管体系,以促进农村集体经济组织长远发展的现实性和实效性。