背景和目的早发型脊柱侧凸（early-onset scoliosis,EOS）是指发病年龄早于10岁的脊柱侧凸。早发型脊柱侧凸可造成进展性的外观畸形及心肺功能受限,严重影响儿童的运动能力及身心健康。由于EOS的病因复杂,且有多种孟德尔疾病相关基因突变的参与,明确早发型脊柱侧凸的分子遗传病因可对脊柱侧凸的临床诊疗以及人群的产前筛查起到重要辅助作用。随着分子遗传学技术的不断进步,外显子组测序（exome sequencing,ES）已经成为了最重要的遗传检测方法之一,被广泛应用于多种遗传性疾病的检测中。然而,目前尚未有使用外显子组测序针对EOS队列进行分子诊断的队列研究。材料和方法我们招募了 447名于北京协和医院接受手术治疗的中国EOS患者组成队列。我们对这些个体及可配合检测的家庭成员（共计670名受试者）进行了外显子组测序。另外13例来自美国的特发性早发脊柱侧凸患者的外显子组测序结果也纳入了分析。我们使用“协和流程”对外显子组测序结果进行生信分析及突变解读。除了能对患者进行分子诊断的突变之外,我们还对ACMG推荐的临床可干预的的次要发现进行了分析。进一步地,我们使用随机森林模型对不同诊断亚组的患者进行了表型关联分析。结果在外显子组测序数据处理和突变解读后,我们在447例中国EOS患者中发现了 92例（20.6%）患者的致病基因与分子诊断。其中41名EOS患者被诊断为TBX6相关性先天性脊柱侧凸;46名患者获得了其他孟德尔疾病的分子诊断;我们还在五名患者中发现了致病性CNV,包括两个16p13.1重复,一个22q11.2缺失,一个5q35.3缺失和一个17q11.2缺失。我们在9名患者中发现了涉及ACMG推荐的59个基因的次级发现,包括BRCA1、BRCA2、APC、RET、TSC2、COL3A1和LDLR。在92例获得分子诊断的患者中,8例患者原本已经被诊断为综合征型脊柱侧凸,通过本次基因检测得到确证;84例患者的分子诊断指向了其他此前未识别的疾病,因此被重分类为综合征型脊柱侧凸。来自美国的13例IEOS患者中,有1例获得了分子诊断。通过诊断-表型关联分析,我们发现发病年龄、涉及的器官系统数目和Cobb角是预测分子诊断的三个最重要的特征。结论使用ES对EOS患者进行基因检测可获得可观的分子诊断率。EOS具有极高的遗传异质性,临床可以基于ES结果对EOS患者进行重分类。发病年龄、涉及的器官系统数量和Cobb角可以作为决定EOS患者是否进行基因检测及进行何种基因检测的临床指征。