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内蒙古是荞麦生产的主要地区,养麦资源丰富,而对内蒙荞麦营养成分和生物活性物质的研究十分缺乏。为研究内蒙古养麦黄酮类化合物种类和含量,从内蒙古和其他省份共采集了80份甜荞和苦荞样品,用75%热乙醇回流提取,分光光度法测定样品总黄酮含量,超高效液相色谱-四级杆-飞行时间串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS)分析黄酮类化合物的种类,高效液相色谱(HPLC)测定芦丁、槲皮素和山奈酚-3-O-芸香糖苷含量,并对各类荞麦进行黄酮类色谱和质谱特征的比较。甜荞总黄酮、芦丁和槲皮素含量(X±D, mg/100g)分别为36.29±17.26、13.66±8.93和3.35±0.71,苦荞分别为1418.30±244.23、1291.36±278.34和34.43±13.53,苦荞山奈酚-3-O-芸香糖苷含量为62.52±16.63。甜荞总黄酮和芦丁含量内蒙显著高于陕西甜荞样品(p=0.004,p=0.035)。甜养种子总黄酮、芦丁和槲皮素含量均显著高于甜荞粉和甜荞米(粒)；科研机构选育样品均显著高于农家样品。内蒙甜荞黄酮类中芦丁含量最高,还检测到槲皮素、山奈酚、山奈酚-3-o-芸香糖苷、儿茶素、表儿茶素、牡荆素、异牡荆素、荭草素、异荭草素、金丝桃苷、木犀草苷、芹菜素、高良姜素和松属素共15种黄酮类物质。内蒙苦荞黄酮类(12种)较甜荞少,不含荭草素、异荭草素和木犀草苷,山奈酚-3-o-芸香糖苷含量较高,而甜荞少有检出。质谱分析内蒙甜荞疑似含有(表)儿茶素-己糖、(表)儿茶素-二甲基没食子酸酯和低聚原花青素,内蒙苦荞疑似有槲皮素鼠李糖双葡萄糖苷(半乳糖苷)。荞麦黄酮类化合物种类内蒙与其他省份样品基本一致,但内蒙荞麦牡荆素、异牡荆素、荭草素和异荭草素检出率高。黄酮类提取物的UPLC-Q-TOF-MS质谱和HPLC色谱主成分分析(PCA),甜荞、苦养和小麦样品聚类显著分离；甜荞样品的HPLC色谱PCA聚类,内蒙与陕西,科研机构选育与农家品种,甜荞种子与甜荞米和甜荞粉均有分离趋势；科研机构选育的苦荞种子与农家的苦养米也有分离趋势,这些分离与各类别间总黄酮差异性检验结果一致。质谱PCA显示不同产地的苦荞有分离趋势。本研究提示黄酮类热乙醇提取物的质谱和色谱PCA分析有望用于荞麦种类、产地及其他分类的判别。色谱和质谱PCA分析结果有一致性,也有差异,不能互相替代。