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獐(Hydropotes inermis),又名河麂、毛獐、牙獐,属于偶蹄目(Artiodactyla)鹿科(Cervidae)獐亚科。獐已经被列为国家二级野生重点保护动物,IUCN红色名录易危(Vulnerable,VU)等级。据国内外研究以及相关报道得知,自然界的偶蹄类食草动物具有独特消化方式,并普遍存在着舔盐习性。本研究对獐的消化道微生物进行检测,分析其消化道微生物功能,并选取样本个体进行了补盐(NaCl)实验,通过监测獐粪便微生物来探究盐对獐的消化道微生物的影响。本实验从2015年6月至2016年12月,从明珠湖公园,松江浦南林地,浦东华夏公园三个地点取得消化道内容物样本。分别来自自然死亡的植食性成年獐3头,半植半饲獐2头,幼獐2头。2016年7～8月,对上海动物园持续补盐实验,得粪便样本62份。浦南林地饲养半植半饲獐约45头,广泛补盐样本12份。使用粪便微生物提取试剂,提取消化道和粪便中的微生物DNA,对微生物的16S rRNA的v3-v4可变区进行高通量测序,测序长度为468bp。主要研究成果如下:1.消化道和粪便中,可测出的含量超过1%的微生物一共有16个门。其中消化道中占9个门,104个属;粪便中16个门,148个属。粪便里包含消化道里所有门水平微生物。消化道和粪便中的优势菌均为厚壁菌门。2.消化道各段微生物多样性(不区分食性)做One-Way ANOVA分析,进行多重比较结果得出:门水平上无显著差异,属水平上,盲肠内微生物多样性与胃内的微生物多样性有显著差异(P=0.049),盲肠内微生物多样性与十二指肠内的微生物多样性有显著差异(P=0.045)。其他各段两两之间无显著差异。消化道微生物多样性排序为:回肠>盲肠>结肠>胃>十二指肠。3.植食性、半植半饲獐消化道的微生物多样性(不区分消化段)做One-Way ANOVA分析,多重比较发现植食性獐消化道微生物与半植半饲獐有显著性差异(P=0.039)。植食性獐消化道微生物和幼獐有显著性差异(P =0.027)。半植半饲獐消化道微生物和幼獐无显著性差异。不同食性微生物多样性排序为:植食性獐>半植半饲獐>圈养幼獐。4.全饲獐补盐实验发现盐对獐消化道微生物多样性有显著影响。补盐后,粪便中新增微生物 4 个门分别是:Acidobacteria,WCHB1-6,Chlorobi,Nitrospirae,新增属55个。而这些微生物,在停止补盐后,46个属消失,仅有9个属未消失。补盐过程中獐个体与停止补盐后獐个体(不区分雌雄)粪便微生物做One-Way ANOVA分析,多重比较显示具有显著差异(P =0.018)。微生物多样性排序为:补盐獐>未补盐獐>停止补盐獐。半植半饲獐粪便微生物检测结果:对补盐前粪便微生物与补盐后粪便微生物多样性做One-Way ANOVA分析,组间存在显著差异(P =0.041),组内无显著差异。微生物多样性排序为:实验组>对照组。5.对厚壁菌门与拟杆菌门线性回归检验,差异极显著,P=0.000,Pearson相关系数为-5.78,以5～7天为一个周期。厚壁菌门与拟杆菌门呈负相关关系。