当前,一般自首认定中的自动投案标准仍存在许多不统一。自动投案不论是采取形式标准还是实质标准,均会导致认定的偏差。如实供述自己罪行的判断中,供述的范围和程度如何等也未形成共识,导致司法实践中对于一般自首的认定仍存在明显的差异。准自首的认定过程中,对于何谓司法机关,何谓尚未掌握等的认识也有分歧。特别自首的认定过程中,最难以判断和把握的是其与坦白、立功的关系,以及特别自首与贪污、受贿、行贿等的关系如何处理等。导致上述种种困境的原因,既有法律语言自身的模糊性和不确定性本身的原因,也有司法解释不详尽等原因,还有司法实践和司法政策等的原因。因此,首先应当明确自动投案的认定标准,如自动投案的时间、对象、方式和动机等,还要明确如实供述和自己罪行的两个核心要素的判断标准,再要明确准自首中被采取强制措施和正在服刑的判断标准,最后还要明确司法解释的各项规定之间的逻辑,深刻领会其中的精神实质,并在实践中准确掌握相关的线索和材料,正确适用自首相关规定指导司法实践。