西北尾矿区天蓝苜蓿根瘤菌多样性研究

来源 :西北农林科技大学 西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:basilmhb
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本论文以西北地区尾矿区天蓝苜蓿根瘤菌为研究对象,采用多种方法对其遗传多样性和表型多样性进行了研究。遗传多样性的研究方法有16S rDNA PCR-RFLP及全序列分析,IGS PCR-RFLP,nifH和nodA的全序列测定,系统发育树的构建等;表型分析包括106项生理生化测定和数值分类。16S rDNA PCR产物用3种限制性内切酶,得到4种酶切图谱类型,第一大类型有64株菌,选择代表菌株CCNWSX0018-1进行测序,系统发育树构建结果表明属于中华根瘤菌属分支;第二种类型有3株菌,代表菌株CCNWGS0031-1测序结果进行序列比对和系统发育树构建结果表明属于土壤杆菌属分支;第三种类型只有1株菌CCNWSX0025-2,测序结果和系统发育树结果表明属于根瘤菌属分支;第四种类型也只有1株菌CCNWGS0046-1,其属于土壤杆菌属,但与CCNWGS0031-1分属不同的种。IGS PCR-RFLP的结果与16S rDNA PCR-RFLP的结果基本一致,个别菌株有差异,说明天蓝苜蓿根瘤菌多样性极其单一。对其共生质粒基因nifH和nodA进行的RFLP结果分析表明:固氮基因酶切图谱有两种类型:AAA型(共51株)和BAA型(共14株),测序结果表明均为与草木樨中华根瘤菌共生基因。来自甘肃徽县的14株菌中,8株菌的nifH基因型为BAA型,6株菌的基因型为AAA型;甘肃成县的13株菌中,有3株为BAA型;陕西凤县和太白两地金矿尾矿区的29株菌全部属于AAA型;陕西宁强县的6株菌有1株是BAA型,5株是AAA型;略阳县的3株菌有2株是BAA型,1株是AAA型。这说明固氮基因有一定的地域差异性。nodA基因相对比较保守,3种酶酶切后的图谱类型均只有一种,测序结果是中华苜蓿根瘤菌的共生基因。供试菌株的表型多样性相对遗传多样性较丰富一些,一些在遗传型上没有区别的菌株也能较好的分开,分析原因可能是环境胁迫影响了一些数量性状,但没有引起16S rDNA上的变化。综上分析可见西北尾矿区天蓝苜蓿根瘤菌多样性比较单一。
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