流域自然天成,人类择水而居,农牧业临水而兴,工业沿水而建,环境问题因此而生。西部地区是我国生态系统聚集区,是国家生态战略基地。保护流域内生态系统对于西部地区经济、社会可持续发展具有十分重要的意义。法制是保护西部地区流域生态环境良性运行的基本理性工具。本论文以系统流域观(流域经济系统与生态系统的相互作用)、系统权利观(公民生态环境权、公民生存权和经济发展权相互制衡)为视角,立足于前辈学术成果力争在流域生态环境保护基本制度建设方面有所推进。论文由六章组成。第一章是西部地区流域生态环境保护法制基本理论。第一节是西部地区生态环境保护之流域模式。一般来说,生态环境保护共有三种模式：一是区域模式；二是流域模式；三是区域与流域并用模式。流域系统是一种自然、社会和经济综合系统。笔者认为对于流域生态环境保护应该采取流域模式。为此,在该节分别论述了西部地区流域系统、流域生态系统的结构以及流域生态系统是流域系统中经济活动的物质源泉和作用对象等命题。在流域生态系统中,河流生态系统是度量流域生态系统功能的标尺。河流生态系统,尤其是水资源流量及走势的变化,决定着流域生态系统的繁衍与演化。本节还探讨了生态环境的概念框架。笔者认为生态环境具有相对性、系统性,是环绕于某生态系统的自然因素和社会因素的总和。在设定本论文研究视角和概念框架基础上,本章第二节从唯物史论角度考察采集和狩猎文明、农业文明、游牧文明、工业文明与流域生态环境之间的关系,试图发现流域生态环境的发展演变规律。通过考察流域生态环境保护与人类文明的关系史,使本论文建立在较为丰富的环保规律基础之匕,并使流域产业结构调整与流域生态环境保护有机结合起来。第三节是西部地区流域生态环境保护法制理论基础。流域生态阀值是保护流域生态环境的根据。流域生态系统以生态阀值为根据,具有其自身运行规律。公民生态环境权来源于流域生态阀值和生态规律对于公民生存权和经济发展权的限制,是流域生态环境保护基本制度设计的法理基础。流域生态系统保护法律制度及运行机制完善均应建于此权利框架之内。对于生态环境权与生存权、经济发展权的制度安排,立法不可偏执一端。尊重流域生态阀值和生态规律,是解决公民生存权、经济发展权与生态环境权之间矛盾的根本途径。第二章是西部地区河流生态系统污染与现行法律制度。第一节是西部地区流域产业规划制度缺失。传统国民生产总值考核重经济、轻环保。在传统国民生产总值考核制度和非均衡趋利行政机制主导下,政府公务人员选择了有利于自身升迁的牺牲生态环境而发展经济的模式,而不是贯彻落实生态环境保护法律制度,从而导致了高污染企业沿岸建厂。同时,饮用水水源区规划制度在一定程度上对于流域产业布局具有规范作用,但该制度设计未考虑流域的系统性而具有较大的局限性。第二节是西部地区流域污染防治制度反思。其主要包括三个方面：即流域有毒有害物质监管制度滞后、流域污染防治标准制度效力弱化、流域污染物总量控制二元分割。第三章是西部地区流域生态破坏与现行法律制度。第一节是反思环境影响评价制度。笔者通过研究目前的环境影响评价法律法规,认为该制度在适用于流域生态环境保护方面存在如下五个问题：流域环评立法理念错位、流域规划环评非系统性、水电开发环评程序立法冲突、流域环境影响评价范围滞后、环评筛选机制倒挂。第二节是流域生态保护经济调控制度滞后。本节以公民生态环境权、公民生存权和公民经济发展权为理论基础,对流域生态补偿的理论进行新的、因果阐释。笔者认为,流域生态补偿实质是为保障公民生态环境权而剥夺公民生存权的行政行为,并提出在此理论基础上构建流域生态补偿制度。本节还提出了当前流域生态税制度缺失问题。第三节是流域水资源分配与生态保护。当前紊乱的水资源分配价值体系导致水资源分配机制错位,并进而导致流域生态系统衰败。对于水资源分配来说,如何建构高效、公平的水资源分配制度,不但是一个对于行政机制和市场机制优化选择的问题,更是一个以公民生存权、经济发展权和生态环境权为基础的价值判断过程。第四节是流域地质变动与流域生态环境保护。本节举例说明了流域内地质保护对于生态环境的影响。第四章是西部地区流域生态环境保护与现行制度运行机制。第节是流域环保行政执法机制不完善。其主要表现在：行政监督效率低、环保行政管理体制条块分割。第二节是流域环保司法体制和队伍有待深化建设。流域环保公益诉讼制度有待立法规定。此外,西部地区司法人员业务素质相对较低。第三节是流域环保主体守法机制缺失。这主要是因为：公民环保意识淡薄和趋利性、环保行政主体和企业的趋利性；政府官员受传统国民生产总值考核制度约束以及其权力缺乏有效制约等。第五章是西部地区流域生态环境保护立法完善。完善立法应该建立以系统权利观为基础的法制运行机制；以系统流域发展观为基础的利益协调和规划制度；以系统保护观为基础的预防制度；以公民生存权和生态环境权有效平衡为核心的经济调控制度。同时还要考量西部地区流域经济发展模式中,工业生产、农业生产和农牧文明对于流域生态系统保护立法以及法律实施的影响。流域生态环境标准制度的理论基础是流域生态阀值,是设定其它制度的基础和根据。流域生态环境标准制度主要包括流域生态环境标准制定主体、流域生态环境标准体系、流域生态环境标准性质。生态系统规划与产业禁限制度是在宏观层面从源头预防生态破坏和污染的制度,其设定既要重点考虑对流域生态系统的保护,同时还要考虑对公民生存权和经济发展权的保护,二者契合点在于流域生态环境标准。流域生态和产业规划制度主要包括流域生态规划制度、流域产业规划制度。流域环境影响评价制度是根据流域生态环境标准对政府、企业和公民开发、利用生态系统的经济活动进行评估的程序性约束。其首先考虑是否符合流域生态系统规划和产业规划,然后再考虑经济活动会对流域生态系统造成何种后果,并据此对流域经济活动进行审批。对于流域生态环境预防制度的完善主要包括扩大流域环评范围、完善流域环评筛选机制、理顺水电环评程序。流域河流生态系统污染防治制度是根据生态环境标准保护河流生态系统免遭工业和农业污染的制度。河流生态系统污染治理制度的完善主要包括完善流域工业污染物治理制度和强化流域农业污染物治理制度。流域内农业污染物治理应该推行行政指导与生态农业经济激励机制。流域生态保护经济调控制度以及水资源分配制度是以保护流域生态系统免遭破坏为宗旨,经济调控制度以禁限制度为前提,禁限制度必须有经济调控制度配合才能取得良好实效。流域生态环境经济调控制度主要包括完善流域生态补偿制度、生态税以及绿色金融制度。流域生态补偿制度主要涉及制度的性质、法律关系、补偿义务主体、补偿范围、补偿额度、补偿救济、适用范围等方面。本部分还认为,生态补偿致贫现象的根本原因是通货膨胀。生态税和环境污染税是抑制流域生态系统污染和破坏的两种重要经济调控手段。其设定既要考虑流域生态阀值,既又要考虑通货膨胀的影响。流域开发绿色金融政策应该纳入金融法律制度体系,以提高法律层级、增强法律效力。流域水资源分配制度是通过对水资源利用价值的考量,进行理性利用的规则体系。立法应该建立行政机制与市场机制相辅相成的流域水资源分配体制。其中,流域水资源一级分配,依靠行政机制来调节；二级分配则以市场机制为主导。第六章是西部地区流域生态环境保护制度运行机制完善。第一节是流域生态环境保护执法建设。这主要包括确立绿色国民生产总值考核制度、建立垂真流域环保管理体制。第二节是两部地区流域生态环境保护司法建设。笔者提出建立流域环保法院和派出法庭、提高流域司法人员素质。第三节是西部地区流域生态环境保护守法建设。笔者提出应该加大普法力度、完善普法机制和建立流域环保守法激励机制。第四节是流域生态环境保护公民参与制度。笔者认为,立法应该根据公民生态环境权,以非政府环保组织为载体,建立流域环境公益诉讼制度,并通过完善环保信息公开制度,在流域环保行政和流域司法行政中实现流域公民参与制度。