近年来国内电子商务飞速发展,电商之间展开激烈竞争,涉及到居民生活的各个方面。由于农产品市场具备一定的特殊性,当前各个电商平台并未进驻该领域,对电商企业而言,该市场无疑是蓝海市场。对现代企业而言,一个重要问题就是如何科学核算物流成本,基于当前的会计制度,企业的物流成本被分摊到很多会计科目或其他费用、成本中,采取混合计算,并没有单独进行核算。自从出现作业成本法、作业成本管理等相关理论以后,极大弥补了传统成本核算的不足,优化成本核算流程,提供准确、直观的成本信息。而且,国内的物联网与物流产业正在飞速发展,我结合当前企业建立的成本核算机制,并分析了作业链等内容,在优化物流管理时给出重要信息,推动物流成本管理更快、更好地发展,有着重要的现实价值及意义。围绕物流成本探讨了生鲜农产品的特征,通过查询有关资料,详细阐述了生鲜农产品相关定义、物流成本理论,接着对电商领域生鲜农产品发展情况加以分析,找出哪些因素能够对电商领域生鲜农产品的物流成本控制产生影响。在分析物流成本时,运用了作业成本法,并建立了成本控制体系。站在战略角度来分析,控制电商领域生鲜企业的物流成本,针对各类影响因素,应用有针对性控制策略,将问题逐个解决。另外,本文还将苍溪猕猴桃交易中心作为研究案例,将理论与实践结合,提出了易操作、针对性的优化措施,从而为电商领域生鲜企业控制物流成本给出可靠方案。