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目的:流行性感冒,简称流感,是由流感病毒(Influenza Virus,IV)引起的急性呼吸道传染病,可造成世界范围内的广泛流行。本研究从流行病学、分子生物学、血清学等方面出发,旨在掌握镇江市流感流行趋势,为该市预测疫苗防治效果及防控流感流行提供科学依据。方法:1.收集2014-2016年镇江市哨点医院采集的流感样病例样本,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)进行病毒分型,从《中国流感监测信息系统》中导出相应的监测数据,结合实验室结果进行流行病学统计分析。2.对流感病毒核酸阳性样本开展病毒分离以获得流行株,分别扩增其HA和NA基因后测序,利用分子生物学软件对序列进行拼接、比对和分析,与WHO推荐的北半球疫苗株以及省内外代表株等比对溯源。3.对不同年龄组健康体检人群进行甲型H1N1、甲H3、乙型(BY/BV)流感抗体水平检测和分析。结果:1.2014-2016年镇江市流感的流行具有季节性,冬春季是其发病高峰,夏季也会出现小的流行。三年流行株以甲型H1N1、甲H3、乙型(BY/BV)混合交替流行为主。流感病毒对性别的敏感性无差异,但是60岁及以上、5岁~人群感染阳性率仍最高。七个辖市区均有流感病毒的检出。2.十三株甲型H1N1分离株与疫苗株A/California/07/2009的HA和NA核苷酸同源性均在95.6%以上。七株HA与江苏株A/Jiangsu-Danyang/SWL1836/2014的亲缘性最近,一株与疫苗株高度同源。九株NA与疫苗株聚集在一起。与疫苗株HA氨基酸位点进行比对,Sa区十一株发生了K173Q突变,一株同时发生K181E突变;Ca1区三株发生V183I突变,但是受体结合位点、糖基化位点均未发现变异,抗原性没有发生改变。3.十三株甲H3分离株与2014/2015疫苗株A/Texas/50/2012、2015/2016疫苗株A/Switzerland/9715293/2013相比,HA和NA的核苷酸和氨基酸同源性都保持在94.8%以上。两株HA与2013/2015疫苗株A/Texas/50/2012高度同源,一株与2015/2016疫苗株A/Switzerland/9715293/2013同源。共有十株发生了多个氨基酸位点的突变,但相关耐药位点氨基酸以及糖基化位点基本保守。4.十四株乙型分离株,BY之间、BV之间HA和NA的核苷酸和氨基酸的同源性均在95.2%以上。两株发生了HA-Y2/NA-V1的系间重配,一株发生了HA-V1/NA-Y2的系间重配。BY系毒株与2014/2015疫苗株B/Massachusetts/2/2012比较,普遍发生120环、150环、190螺旋等氨基酸位点改变的有5株;与2015/2016疫苗株B/Phuket/3073/2013比较,普遍发生120环、150环、190螺旋氨基酸位点改变的有五株。BV系毒株与疫苗株B/Brisbane/60/2008比较,发生120环、150环等氨基酸位点改变的有两株,发生120环氨基酸位点改变的有一株,其中一株还同时发生了I97M突变(190螺旋)。对分离株NA活性位点监测尚未发现变异,但有四株出现了新的糖基化位点204NET。5.一千份血清的检测结果显示,健康人群中抗IAV抗体阳性率水平均高于抗IBV抗体水平,。甲型H1N1、甲3、BY和BV亚型流感病毒抗体保护率分别为24.4%、26.7%、28.4%和18.6%,GMT分别为46.1、47.9、66.1和35.5,抗体保护水平总体较低,且高效价的抗体不多。5岁~组和15岁~组的各型流感病毒抗体阳性率、保护率、GMT值都明显都比其它三组人群高,而60岁及以上组值都较低。阳性抗体人群中,40.7%出现了同一个体多次感染不同亚型流感病毒的现象。结论:1.2014-2016年镇江市流感病毒呈现多种亚型混合流行的状态,每种亚型所占比重不同,提示需要长期开展流感监测以进一步揭示其流行规律。在流感流行季节需重点关注老人和小孩,加强流感防治的宣传教育,针对特定的年龄段使用特定的疫苗,防止群体性流感疫情的爆发流行。2.十三株镇江甲型H1N1分离株基因多态性增加,没有发生抗原性的改变,受体结合位点、糖基化位点均未发现变异,结合同源性分析,提示WHO推荐的疫苗株A/California/07/2009仍具有较高的免疫保护作用。3.十三株甲H3分离株有可能是由其它省份的病毒迁徙所致,部分毒株与疫苗株有差异,虽未形成新的亚型,但其基因特性和抗原性出现了一定程度的变异。相关的耐药位点以及糖基化位点基本保守,对现使用的神经氨酸酶抑制剂仍然敏感。4.十四株乙型分离株,有两株均发生了HA-Y2/NA-V1的系间重配,一株发生了HA-V1/NA-Y2的系间重配。这种系间重配株是否会造成本地区IBV的局部爆发,还需进一步持续监测。HA1区抗原表位120环、150环、160环以及190螺旋存在着不同程度的点突变,提示部分毒株的抗原性出现改变,疫苗的保护效果可能降低。5.人群甲型H1N1、甲H3、BY和BV亚型流感抗体保护水平总体较低,且高效价的抗体不多,提示本地区易发生流感的流行。因此,我们在开展流感病毒流行病学以及病原学监测的同时,还要继续对分子进化特征、人群流感病毒免疫水平等持续监测,从多角度共同研判流感病毒流行趋势,为流感的防控提供科学依据。