茭白又叫菰[Zizania latifolia（Griseb.）Stapf]隶属于禾本科菰属,是我国第二大水生蔬菜。茭白具有重要的经济、食用、药用、生态、和研究价值。其最主要的食用价值是由菰黑粉菌（Ustilago esculenta）的侵染刺激茎部膨大,形成可食用的肉质茎。内生真菌对茭白可食用茎的形成、品质及营养价值等具有重要影响,然而,我们对于茭白内生真菌的多样研究却鲜有报道。本研究拟系统调查我国南方茭白内生真菌资源并进行系统分类学研究。研究以中国南方部分地区（贵州、湖南、江西及浙江）产的茭白为研究材料,采用经典的组织分离法对茭白内生真菌种质资源进行了研究。并通过对比实验,分析了PDA、PCA、OA、RBA、MEA等5种培养基对茭白内生真菌分离获得菌株影响;通过表面消毒方法:采用75%ETOH（98%）,3.25%Na Cl O,75%ETOH依次浸泡;继而4次无菌水冲洗后利用组织培养法接种到培养基上,再挑取茭白组织块上生长出的菌丝,进行纯化,获得菌株。结合形态学特征和ITS、LSU（部分菌株增加RPB2和TEF1）分子序列,对获得的菌种进行系统学研究和多样性分析。具体结果如下:1.从31320块茭白组织块中共分离得到内生真菌472株,经形态和分子鉴定,隶属于3门,12纲,31目,68科,103属,170种。Hydeopsis属的相对分离频率为23.4,为优势属。其中,未鉴定的疑似新种10种,新物种2种:Anthostomella jiangxiensis和Eballistra jiangxiensis。2.研究发现茭白不同营养器官中内生真菌存在明显差异,根、茎、叶分离的内生真菌分别为:根110株66种,特有物种46种;茎61株43种,特有23种;叶303株105种,特有78种。根茎中共有3种,根叶共有物种10种,茎叶共有10种;根、茎、叶均有物种为7种:Hydeopsis verrucispora、Penicillium citrinum、Penicillium oxalicum、Plectosphaerella cucumerina、Sarocladium oryzae、Sarocladium strictum、Schizophyllum commune。3.不同地区茭白样品中分离得到的内生真菌菌株和物种多样性情况:贵州省75株38种,特有物种23种;湖南省85株44种,特有物种30种;江西省306株122种,特有物种101;浙江省8株2种,无特有物种。本研究对茭白内生真菌进行了分离鉴定和多样性分析,研究结果不仅丰富了植物内生真菌种质资源,而且为进一步开发利用茭白内生真菌次生物质代谢及其对茭白抗病性、抗逆性的意义等研究奠定理论基础。