TLR是一类重要的模式识别受体，可以识别病原微生物保守的病原相关分子模式，启动一系列信号转导过程，激活宿主先天性免疫应答，继而调节特异性免疫反应。哺乳动物TLR及其信号通路相关基因功能研究已经取得较大进展，而鱼类相关基因功能研究极其匮乏。本研究以石斑鱼为模型，研究鱼类TLR信号通路相关基因功能，取得的主要结果如下:1）通过同源克隆和RACE的方法，获得了石斑鱼IRAK-4、IRAK-1、TRAF6和Tollip等4个TLR信号通路相关分子的序列，结构分析表明石斑鱼和其它鱼类这4个分子都具有哺乳动物同源蛋白的重要功能结构域，且大部分功能位点也是保守的。多序列比对和进化分析显示，石斑鱼与其它鱼类同源蛋白的相似度较其它脊椎动物高，且在进化树上鱼类同源蛋白聚为一支。定量检测了IRAK-4和TRAF6在健康石斑鱼以及刺激隐核虫感染后不同组织中的表达情况，发现这两个基因在所检测的组织中均有表达，且寄生虫感染能调节其表达量。2）利用新一代高通量测序技术，我们测定了刺激隐核虫感染后不同时间点不同组织的28个石斑鱼样品，组装后得到150811个unigene，其中48376个unigene在UniProt数据库中得到注释。通过GO和KEGG Pathway分析，我们鉴定到1526个免疫相关基因和14条重要的免疫相关信号通路基因，其中包括我们特别关注的TLR及其相关信号通路基因，如NF-κB信号通路、MAPK信号通路、apoptosis信号通路、PI3K-Akt信号通路和Jak/STAT信号通路等。3）通过报告基因实验和激光共聚焦显微镜观察，我们研究了MyD88、IRAK-4、IRAK-1、TRAF6和Tollip等5个基因对NF-κB信号的调节能力，并确定了各蛋白的亚细胞定位。发现过表达石斑鱼MyD88、IRAK-1和TRAF6能激活NF-κB，而IRAK-4和Tollip对其活性无显著影响;然而，IRAK-4和Tollip却能抑制MyD88诱导的NF-κB活性，其中IRAK-4的负调控作用为鱼类特有;以上5个基因重要功能结构域或位点的缺失（突变）能在不同程度上抑制其对NF-κB活性调节作用。此外，以上5个蛋白都定位在细胞质中，其中IRAK-4和IRAK-1在细胞质中均匀分布，而MyD88、TRAF6和Tollip呈高度浓缩状态聚集，但该聚集状态是否与其细胞器定位相关还有待确定。