长链非编码RNA LINC00996调控非小细胞肺癌增殖、侵袭转移的分子机制研究

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背景与目的近年来的研究显示,长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在剂量补偿效应、表观遗传调控、细胞周期调控、细胞分化、细胞凋亡、衰老及肿瘤发生、发展调控方面发挥重要作用[1,2]。lncRNA具有类型多、数量多和作用机制多等特点[3]。随着高通量转录组测序技术的不断发展,越来越多的lncRNA被陆续发现,但目前大部分lncRNA确切生物学功能及作用机制并不清楚[4]。因此,从众多长链非编码RNA中筛选出有功能的lncRNA并对其调控细胞生物学行为的分子机制进行研究显得十分必要[7]。本研究目的在于初步筛选并鉴定差异表达lncRNA,并进一步探讨其调控非小细胞肺癌增殖、侵袭转移的可能分子机制。方法(1)从基因表达综合数据库(GEO;Http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)中通过SAGE标签查找并筛选出癌旁肺组织与肺癌组织中呈现差异表达lncRNA序列标签,并根据差异表达程度(癌旁肺组织与肺癌组织差异表达相差≥1.5倍)和分子特征选择其中新近鉴定的lncRNA作为候选重点研究对象。(2)采用Real-time PCR的方法在正常支气管上皮细胞(BEAS-2B)和非小细胞肺癌细胞株(NL9980,L9981,A549,H1299,H446等)中进差异表达验证,并根据差异表达水平挑选lncRNA LINC00996作为后续重点研究对象。(3)在30对NSCLC患者的肿瘤组织和远癌肺组织中采用real-time PCR方法检测LINC00996的表达水平,在组织水平上验证LINC00996是否存在NSCLC患者肿瘤组织与癌旁肺组织差异表达情况。(4)根据LINC00996全长序列,由上海吉玛公司设计并合成3条针对目的序列的小干扰RNA(siRNA),采用Lipofect-2000脂质体转染法分别转染3条LINC00996特异siRNA(si-868)、无关的siRNA(si-NC)及针对GAPDH的siRNA(si-GAPDH)。(5)采用流式细胞术检测转染针对LINC00996的小干扰RNA si-868后非小细胞肺癌细胞株周期变化。(6)应用细胞计数仪对转染si-868、si-nc及空白对照组的非小细胞肺癌细胞株H1299进行细胞增殖能力检测,绘制生长曲线,判断细胞增殖能力变化。(7)通过克隆形成实验,比较转染前后细胞增殖能力变化。(8)采用划痕和transwell试验检测转染前后非小细胞肺癌细胞株迁移能力变化。(9)采用western-blot检测下调LINC00996表达前后相关细胞周期通路蛋白表达变化。结果(1)通过SAGE标签查找并筛选出新近鉴定的43个差异表达(肺癌组织与癌旁肺组织表达相差≥1.5倍)的lncRNA。(2)采用real-time PCR的方法进行验证,并根据相应lncRNA在细胞中的表达水平和差异程度挑选LINC00996作为后期重点研究对象。(3)30例配对标本中肿瘤组织LINC00996表达上调者17例,占56.7%;表达下调者3例,占10.0%,上调表达者显著高于下调表达这(P<0.05)。(4)合成小干扰RNA并成功下调长链非编码RNA LINC00996在非小细胞肺癌细胞株H1299中的表达;(5)下调LINC00996表达后,H1299细胞增殖能力降低(P<0.05)、G0/G1期细胞比例上升(P<0.05)、细胞凋亡及衰老比例升高(P<0.05)、迁移能力下降(P<0.05);(6)下调长链非编码RNA LINC00996后磷酸化Rb蛋白p-Rb表达量降低,而总Rb蛋白无明显变化,P15蛋白表达量升高,c-myc表达降低,符合细胞增殖信号通路被抑后相关蛋白的变化趋势。结论(1)长链非编码RNA在肺癌细胞与正常支气管上皮细胞,以及肺癌组织与癌旁肺组织间存在明显的差异表达;(2)长链非编码RNA LINC00996在多种肺癌细胞株及肺癌组织中呈现高表达,但在正常支气管上皮细胞及癌旁肺组织中呈现低表达;(3)长链非编码RNA LINC00996可能参与调控肺癌细胞增殖、迁移、凋亡、细胞周期及细胞衰老的等细胞生物学过程。(4)LINC00996参与调控细胞增殖可能是通过与磷酸化Rb、P15及c-myc等蛋白信号通路相互作用实现的。
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