呼吸道合胞病毒P蛋白NTPase活性与解旋活性研究

来源 :中国科学院大学(中国科学院武汉病毒研究所) | 被引量 : 0次 | 上传用户:longfushen
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus,RSV)是一种不分节段的负链RNA病毒(Single-stranded,non-segmented,negative-sense RNA viruses,NNSVs),属于单分子负链RNA病毒目(Mononegavirales),肺炎病毒科(Pneumoviridae)。RNA在有效地折叠到特定结构和在结构构象之间转换方面面临着巨大的挑战。此外,由于RNA侧链的多样性有限,非天然碱基对很可能在折叠过程中形成,形成没有功能活性的错误结构。且因为没能折叠成正确构象的RNAs中含有大量的双链区域,他们很难被重新折叠形成正确的构象。宿主和病毒会编码产生RNA重塑蛋白(RNA remodeling proteins),将错误折叠的RNAs重新折叠成正确的构象。这类蛋白能够打开错误折叠的RNAs的双链区域,并重新折叠成正确的构象,使得RNAs能发挥其正确功能。根据RNA重塑蛋白对于NTP的依赖性分为两大类:RNA解旋酶(RNA helicase)和RNA分子伴侣(RNA chaperone)。对于RNA病毒来说,病毒本身所编码的RNA解旋酶能够促进RNAs折叠或重折叠成正确的构象,在病毒转录和复制中发挥重要作用,在病毒生命周期中发挥关键作用。RSV是一种普遍存在的病原体,主要感染婴幼儿、老年人和免疫力低下的成年人,能致使严重的呼吸道疾病。RSV感染的高发病率与高流行性导致所有人在三岁以前至少感染过一次该病毒,这也使得RSV成为严重的公共卫生问题之一。RSV的P蛋白同NNSVs中其他病毒的P/VP35蛋白的功能类似,是一个多功能蛋白,能与多个蛋白相互作用,并能与聚合酶L,核蛋白N,基质蛋白M2-1相互作用起始病毒的转录和复制。但是,对于RSV是否编码解旋酶知之甚少。在本论文中,我们体外纯化得到了真核表达的P重组蛋白,发现P蛋白具有NTPase活性和类解旋酶的活性(helicase-like),能高效率地水解ATP、GTP、UTP,且表现出GTP>ATP>UTP的利用率,而对于CTP则不具有水解活性,并能够解开双链RNA。此外,我们也对P蛋白的NTPase及类解旋酶活性进行了进一步的解析,发现P蛋白必须在具有NTPs(不包括CTP)和金属二价阳离子的存在下才能发挥这两种活性。在反应体系中含有ATP的情况下,RSV P能同时解开3’端和5’端突出双链,且对于5’端突出双链的解旋活性强于3’端突出双链。进一步将ATP设置成浓度梯度,发现P蛋白对5’端突出双链的解旋活性随着ATP浓度的增加能增强。进一步通过突变,我们找到了P蛋白的NTPase活性位点,并证明了P蛋白的NTPase活性是发挥其解旋依赖所必不可少的。我们的研究首次在肺炎病毒科中发现了病毒蛋白具有NTPase与类解旋酶活性,并找到了其NTPase活性位点,这为RSV的抗病毒药物的研发提供了新的靶标。
其他文献
学位
猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(Transmissible gastroenteritis of swine virus,TGEV)及猪轮状病毒(Porcine rotavirus,Po RV)是引起仔猪腹泻的主要病毒。以PEDV的M基因,TGEV的N基因,Po RV的VP7基因为靶基因,设计特异性引物及不同荧光基团
冰川被称为气候变化的指示器,在全球气候变暖的大背景下,山地冰川发生着巨大的变化。冰川表面温度强烈影响冰川消融,对冰川表面的热物理过程非常敏感。冰川表面温度被广泛用于冰川物质平衡模型、冰川动力学模型和表碛覆盖模拟,表征着气候条件和冰川表面属性的长期动态变化。时至今日,大量基于特定传感器的反演算法可用于表面温度研究,主要包括单通道算法、劈窗算法和多通道算法三大类。目前,针对普通地表温度、海洋表面温度和
事件抽取旨在将文本中的事件信息抽取为结构化的数据形式,对于信息检索、事理图谱的构造有重要作用。现有的事件抽取方法大致可以分为管道方法和联合方法。管道方法存在错误累积的问题,近期的大部分工作都采用联合方法进行事件抽取。然而大多数句子级的事件抽取联合方法缺少文本的整体信息以致无法很好地处理触发词的二义性问题,而文档级的抽取方法存在建模复杂的问题;另外,由于事件触发词和事件元素在句子中的关系紧密,事件抽
尼帕病毒(Nipah virus,Ni V)是副黏病毒科亨尼帕病毒属的单股负链RNA病毒,感染人的致死率高达40%-75%,属于生物安全四级病原体,但目前仍无上市的预防性疫苗和治疗性抗体。在研疫苗多为成本较高的活载体疫苗或哺乳动物细胞表达的真核亚单位疫苗。鉴于Ni V频发的地区主要在经济欠发达国家,低成本和低价格成为Ni V疫苗研发的一个重要方面。研发高效治疗性抗体也是快速、有效控制潜在Ni V爆
2010-2020近十年时间里,移动端界面设计流行着一种技术复古的趋势。19世纪八九十年代至20世纪末由于技术局限产生的阶段性视觉特征,在近十年以移动端为媒介,呈现阶段性规律重新回溯到大众视野中并流行成为设计风格。其中几种风格至今仍是移动端设计应用的热点,但目前针对具备技术复古特点的这一类风格的研究相对分散。风格的符号特征、发展脉络、演进趋势,尤其是这一类风格间的协同演进及背后的社会审美喜好的观念
基于传统村落活态性内涵,从村落人口、物质遗产以及非物质遗产3个方面构建传统村落活态性评价指标体系。通过访谈问卷、实地踏勘、文献查阅等方法获取数据,根据发展路径的差异划分传统村落类型,对分属旅游发展型、传统技艺型、综合开发型和生活服务型的湖南省永州市4个传统村落活态性进行测度。结果表明:(1)失活现象在各类型传统村落中较为普遍;(2)不同类型传统村落人口活态情况差异明显,其中旅游发展型村落人口活态性
灌注CT是一种功能性成像,现在被普遍用于中风症状的诊断。由于CT较少的断层成像图和影像组到介入组较长的运输时间,为了保证病人的最佳治疗时间,将灌注功能从传统CT迁移到C型臂CBCT有极高的应用价值。但是迁移后的灌注功能面临两个新问题,一是时间采样问题,二是时间分辨率问题,两者皆是C型臂较慢的扫描速度导致的,会导致成像结果的偏差以及灌注参数的计算误差。此外,由于动态扫描剂量较大,而直接使用低剂量成像
长江流域在我国经济社会可持续发展中占有重要战略地位,其中上游地区是长江径流的主要来源区,也是我国重要的水电开发基地,对于全流域的水资源合理配置和综合开发应用具有重要意义。近年来,在气候变化背景下,长江上游地区的气温、降水发生了显著变化;同时,“长治”、“天保”等生态工程的实施,改变了流域下垫面环境;上游地区水电开发强度的加大,也影响流域天然水文循环过程,这些都使得区域径流、输沙过程发生变化。因此,
随着生物医学技术的发展,研究人员需要花费大量的时间挑选遗传风险相关文献并对其进行遗传风险信息的抽取,因此,自动化分类遗传风险文献并抽取遗传风险关系是生物医学领域的重要课题。遗传风险研究文献散落在海量生物医学文献中,且医学文献的专业度高,需要专业的研究人员才能分辨;同时遗传风险关系在医学文本中有论元分散、多位点共存的问题存在,给现有的遗传风险信息抽取带来很大的挑战。基于以上背景,本文研究了基于医学文