莲是一种古老的植物，是被子植物中起源最早的种属之一。其为双子叶植物，但又具有某些单子叶植物的特征。胚胎学研究表明，莲胚芽不仅具有特殊的构造，叶绿体的发育也经历了一条独特的途径。所以莲在被子植物的演化中占据着相当独特的地位。 经典的植物学分类将莲属置于毛茛目(Ranales)睡莲科(Nymphaeaceae)之中。莲属因具有与睡莲科各属显著不同的独有特征，人们将它划分为莲科(Nelumbonaceae)，归于莲目(Nelumbonales)。莲属现存两种：中国莲(N. nucifera Gaertn)和美洲黄莲(N. lutea.)。中国莲主要分布在东南亚，而美洲黄莲主要分布在美洲。中国莲与美洲黄莲相比，分布广泛、栽培历史悠久、品种繁多。 本文对莲属38个品种资源，利用花型、花色、皮色、顶芽色等4个质量性状，株高、叶长、叶宽、主藕长、第三节长和粗，主藕重和整藕重等8个数量性状和RAPD分子标记技术进行聚类分析。结果表明： 1．质量性状聚类分析将莲属品种分为3个品种群，品种群Ⅰ包含4个亚品种群。其中花莲和子莲被分在品种群Ⅰ中，藕莲在3个品种群中均有分布。美洲黄莲与花莲一起被归于品种群Ⅰ的亚品种群Ⅰ中。品种群Ⅰ包含27个品种；品种群Ⅱ和Ⅲ分别有7个和4个品种。品种群Ⅰ在株高、叶长、叶宽等性状上居中，品种群Ⅱ最低，但品种群Ⅰ在主藕长、第三节长和粗、主藕重和整藕重等方面显著低于品种群Ⅱ；品种群Ⅲ在8个数量性状上均最高。品种群Ⅰ和Ⅲ为长筒形，品种群Ⅱ为短筒形。主藕重：整藕重以品种群Ⅲ最高，品种群Ⅱ次之，品种群Ⅰ最低。品种群Ⅰ中花色有黄色、红色和白色；品种群Ⅱ多为红色花，品种群Ⅲ均为红花。皮色上，品种群Ⅰ以白色居多；品种群Ⅱ有黄白和黄色等皮色，黄白色稍多；品种群Ⅲ皮色均为白色。参试品种中除大洒锦(花莲)和厦门碗莲(花莲)为重瓣外，其余品种的花型均为单瓣。 2．数量性状聚类分析把莲属品种划分为3个品种群。品种群Ⅰ包括11个品种，品种群Ⅱ和Ⅲ分别有19个和8个品种。美洲黄莲与花莲、子莲一起分在品种群Ⅱ中。品种群Ⅰ除第三节长和整藕重略高于品种群Ⅲ外，其它如株高、叶长、叶宽、主藕长、主藕重、第三节粗等性状上都低于该品种群；品种群Ⅱ在这8个性状上都最低。从藕形指数上看，品种群Ⅰ和Ⅲ均为短筒形；品种群Ⅱ为长筒形。品种群Ⅱ的主藕重：整藕重最高；品种群Ⅰ和Ⅲ依次降低。就花色而言，品种群Ⅰ中除少数野藕为红色花外，其余品种为白色花；品种群Ⅱ中除黄色外还有红色和白色，红色稍多；品种群Ⅲ中有黄白色、红色和白色。皮色上，品种群Ⅰ多为白色；品种群Ⅱ皮色以白色、淡黄和黄白为主；品种群Ⅲ皮色多为白色。顶芽色在品种群Ⅰ中有淡黄、黄和橘黄三色；品种群Ⅱ中则以淡黄为主，有少量黄色品种；品种群Ⅲ顶芽色有黄色和淡黄色两种。 3．RAPD聚类结果表明，利用筛选出的11个引物可有效的将38个莲属品种区分开。试验共扩增出126条带，其中多态性条带71条，多态性占56.35％。聚类分析将莲属品种初步分为3个品种群。品种群l包含27个品种，全部为藕莲品种;品种群11和品种群m分别为6个和5个。品种群I又分为三个亚品种群，亚品种群I包含13个品种，亚品种群11和m分别有10个和3个。美洲黄莲与其它花莲被归于品种群111中。子莲则被分在品种群11中。藕莲和子莲的亲缘关系比子莲与花莲间关系更为密切，藕莲与花莲的亲缘关系最远。品种群I中，唐招提寺莲与所有藕莲品种归为一类，GS较低。该品种群的三个亚品种群中，经济性状上亚品种群I和11优于亚品种群m，亚品种群n最优。品种群11中，麻塔与子莲分在一处，该品种花多，莲蓬多，与子莲极为相似，但其莲子椭圆形，品质差，育种中作藕莲栽培;鄂籽二号是子莲与花莲的杂交种，与其它子莲间显示出巨大差异:鄂籽一号是从江西广昌县的地方品种中选育而成，与来源于福建的子莲有明显的不同。品种群川中洪湖红莲为野生种，与美洲黄莲及其它花莲显示出较大的差异。美洲黄莲与厦门碗莲、大洒锦等花莲品种几乎没有差异。结果还显示三种类型内部各品种间的GS都较高，特别是藕莲，各种类型间品种相互杂交也许是一条扩充各自内部基因的办法。 峨.农艺性状聚类的结果表明，其与RAPD聚类分析有一定的异同。结果显示前者有一定的代表性。而后者与传统的以用途分类极为相似，从而说明该聚类结果具有较高的真实性。三种分析结果综合起来看，美洲黄莲虽与中国莲在表型上有些差异，但在DNA水平上与花莲之间没有明显的差异，认为将其作为中国莲亚种处理的观点有待进一步的验证。品种间的差异性与地理分布有一定的关联，但无必然的联系。是否有差异或差异的大小主要取决于品种本身存在的基因差异。红色是莲藕原始的花色。对花型从单瓣一千瓣的演化关系提出异议，认为黄色、白色和重瓣均为突变所致。推测皮色白色，顶芽色橘黄色为祖征。 5.野生藕与栽培品种的差异在本试验中没有完全体现出来，可能与品种本身以及引物有关。藕莲和花莲各自内部品种都比较难于分开，而两大类型之间则很容易区分开。深水栽培与浅水栽培品种，早熟和晚熟的品种差异性?