目前的许多研究致力于基因和表型间的关系,发现它们之间的生物途径有助于寻找致病基因。一个表型可以被看做一个基因集,因此可以通过研究基因集的关联来发现基因影响表型的机制。目前有许多基因集分析的方法,例如GSEA、FCS等都存在不足。为此我们提出基因集关联分析方法(GSLA),分析基因集之间的关联程度。GSLA利用蛋白质相互作用网络,把基因集内基因看做一个整体,将基因集内的信号聚合从而达到增强信号的目的。GSLA方法的有效性已经在Lin的文章中得到了证明,但关于GSLA算法的程序包或在线分析平台一直没有发布。为此,我们建立了一个在线的基因集关联分析服务,并提供了包括GSLA分析、BPLN查询等功能,为实验生物学家提供了一个实用的工具。本文介绍了GSLA分析平台的基本构架,以蛋白质家族、差异化表达基因、microRNA靶标基因、转录因子靶标基因为例说明如何利用GSLA平台分析基因集数据,并展示了GSLA的有效性和平台的实用性。