水资源是社会经济发展的重要物质资源，它可对生态环境产生良好的影响，促进社会经济平稳持续发展，也可导致环境恶化，影响社会经济的正常发展。怎样能使有限的水资源得到合理的分配和高效的利用是关系到经济发展和人类生存环境的重要问题。因此，水资源的优化配置研究具有重要的现实意义。本论文建立黑龙江省2009年各地区社会经济发展、生态环境状况与水资源开发利用状况综合评价指标体系，应用Delphi法结合层次分析法确定指标权重，分别采用系统协调度模型和模糊聚类方法（传统的FCM算法、改进的FCM算法和模糊聚类循环迭代算法）、神经网络（自组织竞争神经网络和BP神经网络）等智能决策算法，对黑龙江省13个地区现有的水资源配置状况进行了协调性评价和分析。然后以哈尔滨市为例，结合模糊线性加权理论建立目标函数，通过目标达到法和遗传算法对规划水平年提出优化配水方案，然后基于系统协调度模型对两种方法得出的结果进行对比，求得哈尔滨市最佳的水资源配置结果，并提出实现当地水资源优化配置的合理措施和方案，为黑龙江省水资源可持续利用提供了决策参考。