改革开放以来我国医药卫生体制改革已经走过了30多年的历程,在我国的医药卫生体制中,医院是联结政府、医保、药品供应、社区医疗卫生与群众的纽带,改革的许多政策都要通过医院来实现。县级公立医院是县级行政区域内医疗卫生服务体系的龙头和主体,是当前医改的重点和难点[1]。2009年,我国新医改正式拉开序幕,公立医院补偿机制改革作为新医改的主要任务之一,正式提到了医改的议事日程。2013年,以破除“以药补医”机制为关键环节,以改革补偿机制为切入点,我国在311个试点县市全面推开县级公立医院综合改革。县级公立医院综合改革是从改革补偿机制入手,即取消药品加成、完善政府财政补偿、调整医疗服务价格。以改革补偿机制为前提的改革必将会影响医院的经济运行状况,进而影响医院未来的发展。本研究通过对山东省县级公立医院补偿机制改革前后医院经济运行状况进行比较分析和探讨,为医院的可持续发展提供理论和实践依据。本研究阐述了公立医院补偿机制改革的相关理论基础,梳理了公立医院补偿机制的相关概念及模式,介绍了县级公立医院补偿机制改革与发展的基本内容。通过山东省县级公立医院综合改革监测网,收集本研究所需要的定量及定性资料,通过excel软件进行数据的录入和整理。采用正态性检验、方差齐性检验、T检验、Mann-Whitney u检验以及描述性统计方法分析补偿机制改革前后县级公立医院经济运行状况。通过样本县级公立医院相关数据的处理分析,县级公立医院补偿机制改革的成效和问题并存,医院财政补助收入增长明显,但占医院总收入的比重仍较低,药品收入所占比重有较大幅度的下降。公立医院补偿机制改革对县级公立医院经济效益产生明显的影响,但医院服务效率未明显改善。补偿机制改革存在一定的时间效应,短期效果并没有显著性差异,仍需要进一步研究。