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部分石斛属(Dendrobium)植物是重要的观赏花卉,可做盆栽和切花,极具开发利用价值,市场前景广阔。本研究以观赏石斛品种‘紫色火焰’(Dendrobium Mangosteen)和‘粉红2号’(D. Burana Pink No.2)杂交产生的F1代分离群体为作图群体,采取“双假测交”(double-pseudo-testcross)作图策略,构建了一张基于SSR、ISSR和SRAP三种分子标记的石斛遗传连锁图谱。主要研究结果如下：1、四种方法提取石斛作图群体DNA比较研究结果表明：分别加入等体积Tris-平衡酚和氯仿：异戊醇(24：1)进行两次振荡抽提能有效纯化石斛DNA,PEX法提取石斛DNA的A260/A280值为1.99,A260/A230值为2.17,DNA得率为453.39μg/g,该方法提取石斛DNA的得率最高,且纯度好、操作简单,能快速、高效、优质地提取较大石斛作图群体的DNA。2、以两亲本的DNA为模板,分别研究SSR、ISSR和SRAP反应体系中的模板DNA、Mg2+、dNTPs、引物及Taq DNA聚合酶对PCR扩增效果的影响。结果显示,在15μlSSR反应体系中：模板DNA30ng,Mg2+1.5mmol/L, dNTPs2.0mmol/L,引物0.4μmol/L,Taq DNA聚合酶1.0U；在20μlISSR反应体系中：模板DNA50ng,Mg2+1.5mmol/L, dNTPs2.0mmol/L,引物0.75μmol/L,Taq DNA聚合酶1.0U；在20μl SRAP反应体系中：模板DNA80ng, Mg2+2.0mmol/L, dNTPs2.0mmol/L,引物0.6μmol/L,Taq DNA聚合酶1.0U。3、从三种分子标记中共筛选142对(条)多态性引物,最终选出10对SSR、9条ISSR和67对SRAP多态性引物用于石斛F1作图群体的遗传性状分离分析,扩增出599个多态性标记位点(39个SSR,65个ISSR,495个SRAP),其中母本特有位点273个,父本特有位点172个,父母本共有位点154个。在P=0.1的显著水平下,卡方(x2)测验结果为：246个位点呈1：1分离,74个位点呈3：1分离,分别占多态性标记位点的41.07%和12.35%；297个位点偏孟德尔分离,占多态性标记总数的46.58%；未检测到异常分离标记位点。4、利用JoinMap4.0(?)软件,选择CP作图模型,对421个多态性标记位点(其中320个孟德尔分离,101个稍偏孟德尔分离)进行连锁分析(LOD≥4),230个位点(8个SSR,28个ISSR,194个SRAP)被定位于26个连锁群上(大于3个标记),连锁群覆盖长度为1548.9cM,标记位点间平均图距为9.91cM。另外还有10个三联体和22个二联体。