在岩溶地区,农作物生长受到环境限制,生态恢复困难。根际微生物与植物之间的良性相互作用,在植物生长过程中发挥着重要的作用。通过现代分子生物学技术将这种互利共生模式运用于农业和生态修复,可以减少农药化肥的使用,降低地下水污染的风险,实现高效环保的生态农业。为此,本文首先进行野外考察,选取芦竹（Arundo donax,LW）、野燕麦（Avena fatua L.,YM）、稗子（Echinochloa crusgalli,WZ）作为岩溶区典型植物,莎草（Cyperus rotundus L,SC）作为岩溶区非典型植物,采集其根际土,利用宏基因组测序技术分析其微生物群落结构变化和优势菌群;然后利用传统生物学技术分离典型植物根际土中对植物生长具有促进作用的根际细菌,同时利用16Sr DNA测序技术对菌株进行鉴定;随后进行盆栽实验和大田实验来验证促生菌对水稻生长的影响。获得的主要结果如下:（1）宏基因组测序分析结果显示,岩溶区典型植物的根际土壤中微生物丰富度更高,分布更加均匀。非典型植物和典型植物之间的根际微生物群落组成相差较大。三种典型植物根际土壤中均存在芽孢杆菌,而非典型植物SC的根际土壤群落中并没有芽孢杆菌等菌种的存在。典型植物的根际土壤中的微生物与p H、AN、TN这些环境影响因子之间的相关性更加显著。非典型植物根际微生物与青霉素、氯霉素等抗生素抗性基因显著相关。（2）对分离得到的6株菌进行相关PGPs的检测,发现其中的2株菌可以产生吲哚乙酸、赤霉素、细胞分裂素、ACC脱氨酶等PGPs,将这两株菌命名为J1和J2。对这2株菌进行了16Sr DNA的鉴定,结果显示这2株菌同属于芽孢杆菌属,其中J1与Bacillus sp.（in:Bacteria）strain 6063的同源相似性为100%;J2与Bacillus safensis strain 25的同源相似性为100%。（3）盆栽实验的结果显示,接种菌株J12的水稻株高、地上部干重、总干重、总鲜重均显著高于接种单一菌株J1和J2以及对照组CK。接种菌株和对照组之间的土壤理化性质和细菌群落组成之间均存在明显差异。（4）大田实验的结果显示,实验组样地的水稻总产量为637kg,对照组水稻总产量为587kg,相比增产了8.52%。实验组样地水稻中的总磷含量、总镁含量均显著高于对照组样地。实验组样地的根际土壤中的有机碳含量、有效磷含量均显著高于对照组样地。