乳腺癌血清microRNA表达谱差异分析及其功能验证

来源 :广州中医药大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:guanxing1
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目的:以临床确诊的乳腺癌患者和正常体检人员为对象,研究两者血清中miRNAs的表达谱差异,通过筛选验证,获得乳腺癌血清特异性目的miRNAs,加快血清miRNA作为biomarker向临床转化的应用进程,为乳腺癌的诊断治疗提供了新的潜在生物学标志物,同时对miRNA在乳腺癌中的功能进行初步研究,为miRNA乳腺癌发生发展中作用机制研究奠定基础。方法:选取10例确诊的乳腺癌病人和10例正常人样本,利用高通量测序对10对乳腺癌病理组织、旁组织、血清和正常人血清进行miRNA测序,并利用TargetScan、 Clip-seq等数据库筛选出在乳腺癌中特异表达的miRNAs;利用实时荧光定量RT-PCR对筛选结果进行大样本血清验证,利用SPSS统计分析,筛选出差异性表达的目的miRNAs,设计合成miRNA抑制剂,转染至乳腺癌细胞MB-435、MB-468,利用CCK8检测乳腺癌细胞株转染miRNA inhibitor后的活力,利用TargetScan miRanda预测具有功能表达的miRNA靶基因,为功能研究奠定基础。结果:1.分析乳腺癌病理组织、旁组织和正常人血清的miRNA高通量测序测序结果,通过对不同样本的Clean data的比较,分析其共有Reads以及特有的Reads,以log2(Fold Change)>=1、P-value<0.01为差异表达的筛选标准,在986条差异表达中筛选出28个差异性表达的miRNAs,包括hsa-miR-144-3p、hsa-miR-140-3p、hsa-let-7i-5p、 hsa-miR-323-5p、hsa-miR-110a-5p、hsa-miR-29a-3p、hsa-miR-326-5p、 hsa-miR-106b-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-195a-5p、 hsa-miR-19b-3p、hsa-miR-101-3p、hsa-miR-374-5p、hsa-miR-26a、 hsa-miR-23-5p、hsa-miR-19b、hsa-miR-143、hsa-miR-30a、hsa-miR-126、 hsa-miR-125b、hsa-miR-10a、hsa-miR-10b、hsa-miR-99a、hsa-miR-451a、 hsa-miR-320a、hsa-miR-223-3p。2.以差异表达量大于2倍以上,RT-PCR中CT值小于30作为标准,共筛选出4条特异目的miRNAs,即hsa-miR-374a-5p、hsa-miR-223-3p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-320a进行血清学表达验证分析。3.在113例乳腺癌患者以及104例健康对照组血清中对目标miRNAs表达进行定量分析,结果表明miRNAs在血清中稳定表达,乳腺癌组与对照组相比,hsa-miR-374a-5p、hsa-miR-223-3p、hsa-miR-423-5p及hsa-miR-320a相对表达量上调,乳腺癌患者血清中4个目标miRNAs的表达情况与前期乳腺癌组织中的表达情况一致,差异均有统计学意义(P<0.05),目的miRNAs的表达与临床病理特征存在一定相关性。4.我们选取测序结果中和验证的目的miRNAs,利用CCK8检测转染后的细胞活力情况,结果发现,miR-223-3p inhibitor在MDA-MB-468中抑制miR-223-3p的表达,从而抑制MDA-MB-468的活力;同时,miR-423-5p inhibitor在MDA-MB-468和MDA-MB-453中同时抑制这两种细胞活力表达,提示miR-223-3p、miR-423-5p对乳腺癌细胞活性存在调控作用,具有抑制抑癌基因的功能;另利用TargetScan、miRanda两个数据库对miR-223-3p、miR-423-5p的靶基因进行预测,为下一步乳腺癌特异miRNA的功能研究奠定基础。结论:本课题选取乳腺癌组织、癌旁组织以及乳腺癌血清和正常人血清为研究对象,利用新一代高通量测序筛选出差异表达的miRNAs,初步建立了乳腺癌特异性的miRNAs差异表达谱。在对测序结果中表达上调的miR-374a-5p、miR-223-3p、miR-423-5p、 miR-320a血清学验证发现,其在血清和组织中的表达趋势一致,并与临床病理存在着关联,有可能作为乳腺癌诊断的潜在标志物;在利用CCK-8检测4个上调的miRNAs的功能中发现,miR-223-3p、miR-423-5p在乳腺癌细胞中具有功能表达,可能发挥着抑制抑癌基因的作用,影响着乳腺癌的发生发展进程,为miRNA在乳腺癌中的功能研究提供线索。
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