肝癌患者血浆RASSF1A,APC基因甲基化检测的临床应用价值

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目的:抑癌基因RASSF1A和APC基因分别是Ras和Wnt两个信号途径中的分子,以往已有一些研究证实在原发性肝癌(以下简称肝癌)组织中可检测到这两个基因的异常甲基化,但研究结论尚不一致。大多关于抑癌基因RASSF1A、APC启动子区域的DNA甲基化检测多采用新鲜组织,但组织标本不适宜肝癌的筛选及早期检测,相较而言血浆标本比较容易获得。一些研究已经证明在肿瘤组织与配对血浆样本中DNA甲基化的改变有很高的一致性,表明血浆中DNA甲基化检测作为肿瘤标记物有潜在效用。本研究采用甲基化特异性聚合酶链反应(methylation specificPCR,MSP)的检测方法,检测肝癌、肝硬化患者及健康人血浆中抑癌基因RASSF1A、APC的甲基化状态,研究其诊断价值,并分析其与临床资料及生存期预后的关系,为研究用于肝癌筛查、临床诊断及预后判断的血清学标记物提供更多依据。方法:1研究对象:2007年5月至2011年9月于河北医科大学第四医院消化内科住院的肝癌患者102例,肝硬化患者80例及健康人100例作为对照。102例肝癌患者中,男性82例,女性20例,年龄在29~84岁,平均年龄为56.62±10.66岁,80例肝硬化患者中,男性患者57例,女性患者23例,年龄在23~78岁,平均年龄为58.68±10.28岁。依据国内临床诊断及分期标准(广州,2001)对肝癌进行临床诊断与分期,肝癌患者Ⅰ期、Ⅱ期和Ⅲ期的例数分别为8例、41例和53例。收集所有患者临床资料,通过电话联系对肝癌患者进行随访。2抑癌基因启动子区域的甲基化检测方法:将经EDTA抗凝的全血2500rpm离心2分钟后取上清液得到血浆标本,用QIAamp DNA Blood Mini Kit试剂盒提取血浆DNA,经亚硫酸盐处理后,用Wizard DNA纯化纯化试剂盒纯化血浆DNA,具体步骤按试剂盒说明书进行,采用甲基化特异性PCR的方法(MSP法)。PCR扩增引物的序列: RASSF1A基因甲基化的引物序列为:上游引物5’-GGGTTTTGCGAGAGCGCG-3’,下游引物5’-GATAACAAACGCGAACCG-3’,非甲基化的引物序列为:上游引物5’-GGGGTTTTGTGAGAGTGTG-3’,下游引物5’-ACTAACAAACACAAACCAAAC-3’; APC基因甲基化的引物序列为:上游引物5’-TATTGCGGAGTGCGGGTC-3’,下游引物5’-TCGACGAACTCCCGACGA-3’,非甲基化的引物序列为:上游引物:5’-GTGTTTTATTGTGGAGTGTGGGTT-3’,下游引物5’-CCAATCAACAAACTCCCAACAA-3’。对抑癌基因RASSF1A,APC进行目的片段的扩增,扩增反应体系为2×HSTMTaqMix Kit,扩增产物通过电泳凝胶成像系统进行甲基化结果分析判定。3统计学分析:所有数据均使用SPSS13.0统计软件进行统计学分析,P<0.05认为有统计学意义。结果:1肝癌、肝硬化及健康人血浆中RASSF1A、APC基因甲基化状态及比较RASSF1A基因启动子区甲基化阳性率在肝癌和肝硬化血浆中分别为51.96%(53/102)和15%(12/80),健康人血浆中未发现甲基化0%(0/100),三组的甲基化阳性率的差异有统计学意义(χ~2=80.944,P=0.000<0.05)。对肝癌组及肝硬化组血浆甲基化进行比较,差异有统计学意义(χ~2=26.677,P=0.000)。健康人组分别与肝癌组及肝硬化组血浆甲基化进行比较,差异均有统计学意义(P=0.000,P=0.000)。APC基因启动子区甲基化阳性率在肝癌和肝硬化血浆中分别为47.05%(48/102)和22.5%(18/80),健康人血浆中未发现甲基化0%(0/100),三组的甲基化阳性率的差异有统计学意义(χ~2=62.429,P=0.000<0.05),对肝癌组及肝硬化组APC基因甲基化进行比较,差异有统计学意义(χ~2=11.700,P=0.001)。健康人组分别与肝癌组及肝硬化组血浆甲基化进行比较,差异均有统计学意义(P=0.000,P=0.000)。2肝癌血浆中RASSF1A,APC基因甲基化状态与临床资料的比较RASSF1A和APC基因甲基化状态与患者的年龄、性别、Child-pugh分级、AFP值大小无关,RASSF1A基因甲基化与肿瘤个数、是否伴有肝硬化、有无门静脉瘤栓及临床分期相关。RASSF1A基因甲基化阳性率在肿瘤多发和肿瘤单发肝癌血浆中分别为60%和36.54%, P=0.018,在伴有肝硬化和不伴有肝硬化中分别56.18%和23.08%, P=0.026,在有门静脉瘤栓和无门静脉瘤栓中分别为67.65%和38.24%,P=0.005,在临床分期Ⅲ期和临床分期(Ⅰ+Ⅱ)期中分别为62.26%和40.82%, P=0.030。APC基因甲基化状态与HBsAg是否呈阳性及有无门静脉瘤栓相关。APC基因的甲基化阳性率在HBsAg呈阳性和HBsAg呈阴性的肝癌患者血浆中分别为55.81%和31.25%, P=0.003,在有门静脉瘤栓组和无门静脉瘤栓组分别为64.71%和38.24%, P=0.012。以AFP≥400ug/L认为AFP检测阳性,AFP<400ug/L认为AFP检测阴性。102例肝癌患者中AFP检测的阳性率为43.14%(44/102),在58例AFP阴性的患者中,31例发生了RASSF1A基因甲基化,占53.4%,27例发生了APC基因甲基化,占46.5%。3肝癌血浆中两种抑癌基因RASSF1A,APC甲基化状态的相互关系102例肝癌患者中,两种抑癌基因均未发生甲基化的占29.41%(30/102),至少有一个基因发生甲基化的占70.59%(72/102),同时存在两个基因甲基化的占28.43%(29/102)。采用Pearson相关分析肝癌血浆中RASSF1A,APC基因甲基化状态的关联程度,发现两中抑癌基因甲基化状态不存在相关关系。4血浆RASSF1A,APC基因甲基化检测对肝癌的诊断价值在肝癌、肝硬化及健康人三组共282例血浆标本中,RASSF1A基因甲基化对肝癌诊断的灵敏度为52%,特异度为93.3%,APC基因甲基化对肝癌诊断的灵敏度为47.1%,特异度为90%,联合RASSF1A及APC基因甲基化检测对肝癌诊断的灵敏度为70.6%,特异度为86.7%。5肝癌血浆RASSF1A,APC基因甲基化状态与生存期预后的关系RASSF1A基因甲基化阳性组的平均生存期为(15.28±2.85)个月,RASSF1A基因甲基化阴性组的平均生存期为(25.86±3.77),两组生存率比较,差异有统计学意义(P=0.011<0.05)。APC基因甲基化阳性组的平均生存期为(17.16±2.81)个月,APC基因甲基化阴性组的平均生存期为(24.69±3.91),两组生存率比较,差异无统计学意义(P=0.175>0.05)。RASSF1A或APC基因至少有一种基因甲基化状态阳性的为72例,平均生存期为(10.80±2.59)个月,两种基因甲基化状态均阴性的为29例,平均生存期为(23.63±4.91),两组生存率比较,差异有统计学意义(P=0.019<0.05)。进一步COX多因素分析结果提示,AFP、临床分期、治疗方式及门静脉瘤栓有无为独立预后因子,RASSF1A和APC基因甲基化状态不能作为肝癌的独立预后因子,但联合检测RASSF1A和APC基因甲基化状态,其中至少一个基因甲基化状态阳性患者,基因甲基化状态检测结果可以作为评价生存期预后的独立预后因子(P=0.019<0.05)。结论:1肝癌组血浆甲基化阳性率显著高于肝硬化组及健康人组,说明RASSF1A,APC基因甲基化在肝癌形成中可能起一定作用。2血浆RASSF1A,APC基因甲基化状态检测对筛查AFP阴性肝癌有意义,且两种基因甲基化状态与肝癌患者有无门静脉瘤栓组相关,RASSF1A基因甲基化状态与患者临床分期分期相关,说明血浆RASSF1A,APC基因甲基化状态可以反映肝癌患者病情与预后。3联合检测RASSF1A和APC基因甲基化状态可以作为评价肝癌生存期预后的独立预后因子。
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