第一部分在RNA干涉(RNAi)途径中,内生小RNAs对于基因的表达与调控起着非常重要的作用,这些小RNAs作用方式有三种:靶标信使RNA的裂解,靶标信使RNA的抑制以及染色质的修饰。植物和动物包含许多微小RNAs—microRNAs (miRNAs),这些miRNAs在包括细胞分化,器官形态建成等许多发育相关生理现象中扮演着至关重要的作用。目前,还没有miRNAs在单细胞生物中报道。本论文中,我们首次发现单细胞生物绿藻—衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)编码许多miRNAs。我们也发现衣藻miRNA在体内和体外都能指导它的靶标mRNA裂解。我们还在衣藻配子产生过程中探究了衣藻miRNA的表达丰度变化情况。除了miRNAs,衣藻体内还包括许多类型的小RNA,一类是phasing siRNAs,这些phasing siRNAs很象植物trans-acting siRNAs,另一类是siRNAs,它们来自于编码蛋白的基因和转座子中。我们的发现表明miRNA途径和一些siRNA途径对于基因的表达与调控是古老的,它们在多细胞生物出现之前就存在。第二部分世界卫生组织(WHO)对人类感染高致病性禽流感病毒H5N1的报道显示,人类感染H5N1的事例越来越多,这引起了全世界人民的极大恐慌。血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)是禽流感病毒H5N1的两种主要抗原。通过HA和NA两种表面糖蛋白的点突变,H5N1禽流感病毒一方面可以扩大自己的宿主感染范围,另一方面可逃避宿主免疫系统对它的识别。通过生物信息学的方法,对亚洲病人来源的H5N1禽流感病毒的HA和NA序列进行了全面分析后,我们发现了许多新的HA和NA突变位点,并且一些突变位点对于人来说是致死的,我们对HA和NA的这些突变特性(包括突变位点的氨基酸属性,受体结合属性以及表面抗原属性等)进行了详细的分析。通过蛋白三级结构建模,我们还发现了HA的一个受体结合位点的改变或许涉及到宿主专一性的改变。总之,我们的结果一方面有利于病毒学家进行实验设计,深入理解流感病毒的致病性机理,另一方面为全面理解流感病毒在亚洲的进化趋势提供了理论依据,对设计禽流感疫苗,进行流感病毒的预防具有重要意义。