近几年,因老年人口比例持续攀升以及疫情不断冲击等一系列因素的作用下,医药制造业的发展伴随着机遇与挑战。在疫情的大环境下,作为与民生紧密相连的行业,企业如何把握机遇、迎接挑战,怎样积极响应国家政策、合理配置资源,提升企业的财务绩效水平,进而提高可持续发展能力,成为了医药制造业上市公司发展过程中需要解决的重点。本文以医药制造业上市公司作为研究对象,首先回顾财务绩效相关文献综述与评价方法,通过比较,确定采用数据包络分析法对财务绩效进行分析;其次,以32家医药制造业上市公司的财务指标数据作为研究样本,使用熵权法计算权重并进行排序,从而确定将固定资产周转率、应收账款周转率、研发投入强度和政府补助力度作为投入指标,毛利率、净资产增长率、每股收益作为产出指标,构建投入产出指标体系;然后,运用超效率SBM模型对近五年32家医药制造业上市公司的财务数据进行分析;最后在此基础上,将综合效率作为因变量,市场份额、高端人才占比、股权集中度、上市年限、专利授权数量以及政府补助六个因素作为自变量,运用Tobit模型分析具体影响因素。本文的研究显示,2016-2020年国内大部分医药制造业上市公司的效率值处于有效状态,说明行业整体财务绩效水平较好,市场份额、上市年限和专利授权数量与企业综合技术效率呈显著相关,并且根据结果分别从市场份额、专利研发等方面提出相应的改进建议,适当扩大市场份额、加强人才培养,以提高企业竞争力并提升财务绩效水平。