论文部分内容阅读
研究目的由于RNA可以通过ceRNA机制调控子宫内膜容受性,我们构建了一个ceRNA网络,并进行免疫组化检测和观察胞饮突的表达,探索子宫内膜异位症相关的子宫内膜容受性潜在生物标志物。材料和方法本研究共纳入16例女性不育患者。所有受试者均处于正常排卵期,月经周期正常(21-35天),年龄在28至37岁。并在子宫内膜取样后3个月内没有接受激素治疗,对8例子宫内膜异位症和8例正常在位子宫内膜进行RNA测、免疫组化检测和观察胞饮突的表达。采用生物信息学算法对ceRNA网络进行预测和通路分析。结果子宫内膜异位症患者与健康受试者相比,共检测到767个mRNA(181个上调和586个下调)、231个lncRNA(99个上调和132个下调)和45个miRNA(11个上调和34个下调)表达差异。构建ceRNA网络,包含45条通路。通过对lncRNA、miRNA和mRNA三组之间的倍数变化进行拓扑分析,共12个共同基因。其中重建的ceRNA网络中有26个miRNA、30个mRNA、32个lncRNA和119条边线。在ceRNA中进一步选择lncRNA,miRNA,mRNA,确定两个共表达模块:模块1中含136条富集的GO通路和3条富集的KEGG通路;模块2含121条富集通路和12条KEGG富集通路。JAK-STAT信号通路、蜕膜化、类固醇代谢过程正调控、脂肪酸代谢过程正调控、氧化还原酶活性可能参与子宫内膜异位症子宫内膜容受性的损伤。确定了hsa-miR-449c-5p、hsa-miR-449a、DRAIC 和 LOC400867 作为预测子宫内膜异位症子宫内膜容受性的候选生物标志物。子宫内膜异位症组和对照组胞饮突表达未见明显差异。子宫内膜异位症患者孕激素受体B型表达水平较低。结论子宫内膜异位症患者与健康受试者相比,共检测到767个mRNA(181个上调和586个下调)、231个lncRNA(99个上调和132个下调)和45个miRNA(11个上调和34个下调)表达差异。基于ceRNA理论,我们重建了一个lncRNA-miRNA-mRNA网络,首次从全系统层面对子宫内膜异位症子宫内膜容受性的lncRNA相关的ceRNA介导基因进行了全面的观察和分析。GO分子功能分析发现了 41条丰富的GO通路。KEGG通路和wikipathway分析表明,这些基因可能参与4条通路。总的来说,通过对lncRNA、miRNA和mRNA三组之间的倍数变化进行拓扑分析,在亲近性、程度、中间性的前25个基因有12个共同基因,其中重建的ceRNA网络中有26个miRNA、30个mRNA、32个lncRNA和119条边线。在重建的ceRNA网络中,GO分类(分子功能)p≤0.05获得38条富集GO通路,KEGG分析发现31条富集通路。ceRNA子网络中蜕膜化和卵巢类固醇生成,以及VEGF和TNF信号通路可能与子宫内膜异位症子宫内膜容受性有关。在ceRNA中利用皮尔森相关分析进一步选择lncRNA、miRNA、mRNA,确定了两个共表达模块:模块1中包含136条富集的GO通路和3条富集的KEGG通路;模块2包括121条富集通路和12条KEGG富集通路。JAK-STAT信号通路、蜕膜化、类固醇代谢过程正调控、脂肪酸代谢过程正调控、氧化还原酶活性可能参与子宫内膜异位症子宫内膜容受性的损伤。我们的研究结果确定了 hsa-miR-449c-5p、hsa-miR-449a、DRAIC和LOC400867作为预测子宫内膜异位症子宫内膜容受性的候选生物标志物。子宫内膜异位症患者上皮细胞子宫内膜孕激素B受体表达水平较低,这也可能与子宫内膜异位症相关子宫内膜容受性受损有关。子宫内膜异位症患者和正常对照组相比,胞饮突表达量未见明显改变。