论文部分内容阅读
目的:耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)引起的院内感染因其高传播率、高病死率、高耐药率引起广泛关注。近年来院内CRKP感染的患者逐渐增多,细菌耐药形势较为严峻。为了防止医院内CRKP的扩散,了解院内感染CRKP的基因型及其进化关系和感染CRKP患者间的传播路径关系,为医院感染防控提供数据支持。方法:收集蚌埠市第三人民医院2018年11月至2019年3月CRKP非重复菌株21株,采用梅里埃VITEK微生物鉴定仪进行菌种鉴定、最低抑菌浓度MIC法和药敏纸片扩散KB法分析菌株对抗菌药物的敏感性,mCIM实验联合eCIM实验检测碳青霉烯酶表型。提取菌株DNA,利用Illumina Hiseq 2500平台进行全基因组测序、SPAdes软件进行序列拼接、Staramr软件分析菌株耐药基因、MLST软件分析多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MST)、Ridom SeqSphere+软件进行核心基因组多位点序列分型(core genome multilocus sequence typing,cgMLST)和构建最小生成树(minimum spanning tree,MST),利用SCOTTI软件根据提取的菌株核心基因、标本的收集时间和患者出入院时间构建传播路径关系图。结果:21株CRKP均携带blaKPC-2型耐药基因,同时MLST分型均为ST11型,而cgMLST分型显示CT3176型(14株,66.7%)为院内流行优势菌株,其它分别为CT1689型(3株)、CT1313型(2株)、CT1814型(1株)和CT3195型(1株)。在MST中我院CRKP被分为3大簇,其中CT3176型别的菌株形成主要的一簇。在具有核心基因组的19株CRKP传播路径关系图中,分析出7号与29号菌株传播概率为42%,12号与17号菌株传播概率为37%,其他菌株间传播概率较低。结论:该院21株CRKP对临床常用抗菌药物呈多重耐药状态且高表达耐药基因。型别分析中21株CRKP均为ST11型,并以CT3176亚型为主并在院内有小范围的播散。根据院内感染传播路径关系图发现由于医务人员手卫生依从性较差,在临床护理当中可能导致CRKP菌株之间的传播。