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目的:基于早期肝癌患者缺乏特异症状和体征,而中晚期肝癌患者治疗效率又比较低并且预后较差,探讨肝癌的早期诊断与其发生机制具有重要意义。miRNA是一类由内源基因编码的长度约为22个核苷酸的非编码单链RNA分子,它们在动植物中参与转录后基因表达调控,其形成过程从长链pri-miRNAs到pre-miRNAs,最后形成成熟miRNAs,可直接结合到mRNA的3UTR,从而抑制mRNA的翻译,导致mRNA的降解,进而影响蛋白质的表达,改变生物过程。SNP是指基因组内单个核苷酸改变时发生DNA序列的多态性变化,SNP决定着群体和个体基因序列的细微差别,是人类基因组最常见的一种变异类型。本研究旨在研究miRNA1269a及miRNA1269a SNP与肝癌发生易感性的关系及其差异和对肝癌细胞增殖、凋亡等生物学特性的影响,验证miRNA与其直接作用靶基因之间的关系及其靶基因对肝癌细胞的生物学作用,进而阐明miRNA1269a及miRNA1269a SNP是对肝癌细胞产生以上生物学影响的具体作用机制。 方法:根据已有的前体和成熟miRNA的SNP数据库,筛选出可能对靶基因结合或miRNA表达量有影响的功能位点,使用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱分析技术在723例肝癌个体和698例健康对照的血液样本基因组DNA中进行SNP分型,分析这些位点的基因频率在病例组和对照组之间的差异,获得与肝癌有关联的位点。 此外,对该关联性研究所示的miRNA SNP阳性位点进一步进行其功能性研究,首先在肝癌患者血浆中通过提取与肝癌易感性相关的阳性miRNA,来确定其表达量与miRNA SNP的关系。再进一步通过TargetScan6.2,miRDB,miRWALK数据库来预测此miRNA SNP的可能靶基因,利用靶基因的显著性功能分析GO-Analysis,靶基因的显著性信号通路分析Pathway-analysis,最后与Cosmic数据库肿瘤相关的癌基因取交集,得到8个靶基因,然后通过miRNA SNP转染的细胞来验证。最后得到两个预测靶基因. 结果:从人类miRNA SNP数据库中共筛选出13个miRNA的SNP位点,发现miRNA1269a中rs73239138(G>A)与肝癌发生风险之间的关联具有统计学意义。与野生型GG基因型相比,AA基因型明显提高了肝癌发生的风险(P=4.32×10-5,OR(95%CI)=2.10(1.47-3.0)),而GA基因型也具有同样的结果(P=5.68×10-13,OR(95%CI)=2.65(2.04-3.46)),而这一效应也同时在rs73239138的显性模型中(dominant model GG vs GA+AA)中显现出来(P=1.28×10-12,OR(95%CI)=2.52(1.95-3.25)),揭示出含有A基因型可以明显提高肝癌易感性(P=1.28×10-12),同理可以看出miRNA1269a的rs73239138(G>A)位点的基因型与肝癌和乙肝相关性肝癌易感性具有相关性,该位点的等位基因型A可增加肝癌发生的风险性,是风险性因子(P=6.19×10-7)。另外发现miR-933的SNP位点rs79402775的基因型与肝癌和乙肝相关性肝癌易感性不具有相关性。 其次,在miRNA SNP与miRNA表达量的研究中发现,miRNA1269a(GA.AA)肝癌患者的miRNA1269a的表达水平较miRNA1269a(GG)水平略低,少量肝癌患者血浆内miRNA1269a的表达水平无统计学差异(P=0.3802和P=0.0537),然而将miRNA1269a及miRNA1269a SNP的前体质粒转染入肝癌细胞系后测得的miRNA1269a的表达水平存在显著性差异(P<0.01)。在最后对miRNA SNP靶基因的研究显示在mRNA水平验证了miRNA1269a rs73239138(G>A)在肝癌发生中的两个预测靶基因分别为SPATS2L和LRP6。 结论:在此次723vs698例病例对照研究中我们阐明了miRNA1269a中rs73239138(G>A)与肝癌发生风险之间存在关联,并作为风险性因素起作用。而在转录水平,miRNA1269a中rs73239138(G>A)的过表达导致SPATS2L和LRP6的表达量下调,提示二者可能是miRNA1269ars73239138产生作用的靶基因。