MiRNA1269a单核苷酸多态性对肝癌易感性的影响

来源 :厦门大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ldw521
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:基于早期肝癌患者缺乏特异症状和体征,而中晚期肝癌患者治疗效率又比较低并且预后较差,探讨肝癌的早期诊断与其发生机制具有重要意义。miRNA是一类由内源基因编码的长度约为22个核苷酸的非编码单链RNA分子,它们在动植物中参与转录后基因表达调控,其形成过程从长链pri-miRNAs到pre-miRNAs,最后形成成熟miRNAs,可直接结合到mRNA的3UTR,从而抑制mRNA的翻译,导致mRNA的降解,进而影响蛋白质的表达,改变生物过程。SNP是指基因组内单个核苷酸改变时发生DNA序列的多态性变化,SNP决定着群体和个体基因序列的细微差别,是人类基因组最常见的一种变异类型。本研究旨在研究miRNA1269a及miRNA1269a SNP与肝癌发生易感性的关系及其差异和对肝癌细胞增殖、凋亡等生物学特性的影响,验证miRNA与其直接作用靶基因之间的关系及其靶基因对肝癌细胞的生物学作用,进而阐明miRNA1269a及miRNA1269a SNP是对肝癌细胞产生以上生物学影响的具体作用机制。  方法:根据已有的前体和成熟miRNA的SNP数据库,筛选出可能对靶基因结合或miRNA表达量有影响的功能位点,使用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱分析技术在723例肝癌个体和698例健康对照的血液样本基因组DNA中进行SNP分型,分析这些位点的基因频率在病例组和对照组之间的差异,获得与肝癌有关联的位点。  此外,对该关联性研究所示的miRNA SNP阳性位点进一步进行其功能性研究,首先在肝癌患者血浆中通过提取与肝癌易感性相关的阳性miRNA,来确定其表达量与miRNA SNP的关系。再进一步通过TargetScan6.2,miRDB,miRWALK数据库来预测此miRNA SNP的可能靶基因,利用靶基因的显著性功能分析GO-Analysis,靶基因的显著性信号通路分析Pathway-analysis,最后与Cosmic数据库肿瘤相关的癌基因取交集,得到8个靶基因,然后通过miRNA SNP转染的细胞来验证。最后得到两个预测靶基因.  结果:从人类miRNA SNP数据库中共筛选出13个miRNA的SNP位点,发现miRNA1269a中rs73239138(G>A)与肝癌发生风险之间的关联具有统计学意义。与野生型GG基因型相比,AA基因型明显提高了肝癌发生的风险(P=4.32×10-5,OR(95%CI)=2.10(1.47-3.0)),而GA基因型也具有同样的结果(P=5.68×10-13,OR(95%CI)=2.65(2.04-3.46)),而这一效应也同时在rs73239138的显性模型中(dominant model GG vs GA+AA)中显现出来(P=1.28×10-12,OR(95%CI)=2.52(1.95-3.25)),揭示出含有A基因型可以明显提高肝癌易感性(P=1.28×10-12),同理可以看出miRNA1269a的rs73239138(G>A)位点的基因型与肝癌和乙肝相关性肝癌易感性具有相关性,该位点的等位基因型A可增加肝癌发生的风险性,是风险性因子(P=6.19×10-7)。另外发现miR-933的SNP位点rs79402775的基因型与肝癌和乙肝相关性肝癌易感性不具有相关性。  其次,在miRNA SNP与miRNA表达量的研究中发现,miRNA1269a(GA.AA)肝癌患者的miRNA1269a的表达水平较miRNA1269a(GG)水平略低,少量肝癌患者血浆内miRNA1269a的表达水平无统计学差异(P=0.3802和P=0.0537),然而将miRNA1269a及miRNA1269a SNP的前体质粒转染入肝癌细胞系后测得的miRNA1269a的表达水平存在显著性差异(P<0.01)。在最后对miRNA SNP靶基因的研究显示在mRNA水平验证了miRNA1269a rs73239138(G>A)在肝癌发生中的两个预测靶基因分别为SPATS2L和LRP6。  结论:在此次723vs698例病例对照研究中我们阐明了miRNA1269a中rs73239138(G>A)与肝癌发生风险之间存在关联,并作为风险性因素起作用。而在转录水平,miRNA1269a中rs73239138(G>A)的过表达导致SPATS2L和LRP6的表达量下调,提示二者可能是miRNA1269ars73239138产生作用的靶基因。
其他文献
直观教学是教师传授生物知识的重要手段之一。插图是生物学的第二语言,又是生物教材内容的重要组成部分,在教学中占有举足轻重的作用。而插图具有语言文字无法比拟的直观、简
许多调查资料表明:数学阅读历来都不被人们重视,一提到阅读,很多人都很自然的想到语文、英语的阅读,而不屑于数学的阅读。许多学生、家长,甚至有的老师都认为数学主要是学会
中学语文课本中选有几十首古诗词曲,在教学过程中,如何利用教材培养学生兴趣,把它教得富有情趣,寓教于乐,融理于情,却不是容易的事。我在初中一个循环的教学中,对古诗词的情
本文通过对荣华二采区10
语言是教学的主要手段。苏霍姆林斯基说过:“教师的语言修养在很大程度上决定着学生在课堂上的脑力劳动的效应……教师讲的话带有审美色彩,这是一把最精致的钥匙,它不仅开发
现代陶艺如何面对时代和生命力的创造性发展,借鉴历史,学习外来文化,注重风格和个性化发挥。在多元、传承、包容的现代,陶瓷壁饰运用多种元素,引入挂件和注释符号,形成新语汇
笔者所任教的山区学校的农村学生在小学阶段基本上都未接触过英语,进入中学后刚开始学英语时他们的学习兴趣是非常浓的,但是由于所学单词记不住,就往往在单词旁注汉字。经过
本文通过对荣华二采区10
心理学研究表明,在青少年心理成长、发展过程中,情感发展是他们社会化发展过程中两个相互联系和协调的基本方面。中学生情感上的健康发展会对他们认知发展,社会适应,道德形成
近年来新发传染病频发,在全球范围内造成了巨大的经济和社会损失.气候变化驱动的地球环境改变打破了生态系统平衡,使得野生动物栖息地丧失,并影响病原体及其中间宿主的繁殖、