审计意见反映了注册会计师对于企业财务报表公允性、合法性以及政策一致性的评价，目前探究审计意见类型影响因素的研究主要集中在上市公司财务业绩、盈余管理、会计师事务所的规模、被审计客户的规模、上期审计意见类型等方面。但是，系统地从公司内部治理角度对独立审计进行的研究却显得相对匮乏。有效的公司内部治理机制意味着低的审计风险，使注册会计师更愿意出具清洁度较高的审计意见。特别是随着审计方法向以客户经营风险为导向的现代风险导向审计方法发展，公司治理质量必然会对审计意见产生重大的影响。因此，本文选择从公司内部治理的角度来探究审计意见的影响因素。　　 本文采用规范研究与实证研究相融合的研究方法，以规范研究为基础，侧重于实证研究，形成一个相对完整的研究体系。即首先运用规范研究方法对审计意见、公司治理以及公司内部治理对审计意见类型的影响进行基本理论阐述；接着以深市A股上市公司为研究样本，选取330家样本公司从2004年至2007年公司内部治理的相关指标进行实证研究，通过Logistic回归分析验证公司内部治理机制各因素及总体水平对审计意见产生的影响，进一步得出研究结论，试图为今后进一步完善公司治理和审计研究体系提供一点思路与建议。　　 本文的实证研究结果表明，就公司内部治理机制各组成要素而言，审计委员会的设置、董事长与CEO两职分离、高管薪酬激励水平、信息披露质量对注册会计师出具清洁的审计意见具有显著的正面影响；第一大股东持股比例、资产负债率对注册会计师出具清洁的审计意见具有显著的负面影响。就公司内部治理机制整体而言，公司内部治理水平越高，注册会计师出具清洁审计意见的可能性也越大。因此，不断完善公司内部治理机制，有利于公司获得清洁的审计意见；注重对公司内部治理机制的评价，有利于会计师事务所降低审计风险，出具恰当的审计意见.