南方水稻黑条矮缩病毒（Southern rice black-streaked dwarf virus,SRBSDV）,是呼肠孤病毒科（Reoviradae）斐济病毒属（Fijivirus）的一个新种。受该病毒侵染的水稻植株表现矮缩,叶色深绿,叶片基部产生皱褶,茎表有瘤突、高节位分蘖等症状。SRBSDV基因组为ds RNA,共10个片段,由大至小分别命名为S1～S10,共编码13个蛋白,其中S1编码的P1具有RNA依赖的RNA复制酶活性（RNA-dependent RNA polymerase,Rd Rp）,S10编码的P10是病毒主要外壳蛋白（Coat Protein,CP）,但有关这两个蛋白在病毒侵染过程中的功能及其在水稻病害症状形成中的作用未知。作者所在实验室前期工作已获得转SRBSDV P1和P10的转基因T0代水稻植株,本研究从其后代中筛选转基因纯合株系,并对纯合株系进行表型观察、抗病性测定和转录组特征分析,以期揭示这两个蛋白在病毒侵染水稻过程中的作用。取得结果如下:1、在T2代中获得2个P1和1个P10转基因纯合水稻株系。从4株T0代转病毒P1基因植株中,获得88个T2代株系,通过RT-PCR检测,从中筛选到2个P1转基因纯合株系P1:1-10和P1:2-12。从6株T0代转病毒P10基因植株中,获得15个T2代株系,经RT-PCR检测筛选到1个P10转基因纯合水稻株系P10:3-5。2、对2个P1转基因纯合株系的水稻植株进行表型观察,结果表明,病毒P1蛋白引致转基因水稻种子发芽率降低、幼苗叶片白化和结实率降低。与野生型（日本晴）相比,两个转基因株系种子发芽率分别下降51.2%和58.1%,叶组织叶绿素含量分别下降16.3%和14.2%,结实率分别减少63.9%和54.3%。3、对1个P10转基因纯合株系的水稻植株进行表型观察,结果表明,病毒P10蛋白引致转基因水稻株高变矮、分蘖数减少和结实率降低。分别为野生型的75.1%、87.2%和29.6%。4、人工接种试验表明,病毒P1和P10转基因水稻对SRBSDV的感病性未发生改变,但显著降低感病植株体内的病毒含量。与野生型水稻相比,接种15d时,2个P1转基因株系植株体内病毒含量分别为对照的5.1%和6.2%,1个P10转基因株系植株中病毒含量为对照的18.1%;接种30d时,两个P1转基因株系植株体内病毒含量分别为对照的28.6%和29.6%,1个P10转基因株系植株中病毒含量为对照的30.5%。5、RNA-Seq分析表明,病毒P1及P10转基因水稻的转录组发生了显著变化。在P1转基因水稻共获得2409801个clean reads,与野生型水稻相比,2487个基因发生差异表达,其中1592个上调,895个下调,多个与叶绿素合成及光合作用相关的基因下调表达。在P10转基因水稻共获得2384153个clean reads,与野生型水稻相比,2934个基因差异表达,其中1316个上调,1618个下调,其中多个与赤霉素合成及诱导相关基因下调表达。6、RT-q PCR检测证实,与野生型水稻相比,P10转基因水稻中多个赤霉素合成及诱导相关基因下调表达,变化趋势与转录组测序结果基本一致,但与SRBSDV侵染诱导的表达模式不尽相同。上述结果为深入研究病毒P1和P10在SRBSDV致病过程中的作用奠定了基础。