长链非编码RNA在系统性红斑狼疮Ⅰ型干扰素通路异常活化中的作用研究

来源 :上海交通大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:guojade_2009
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目的:系统性红斑狼疮(SLE)是一种累及多器官并导致多种自身抗体产生的自身免疫性疾病。最近已发现长链非编码RNA(lncRNA)与多种自身免疫疾病紧密相关,但我们对系统性红斑狼疮(SLE)相关的lncRNA的了解仍然有限。1.本研究旨在探索长链非编码RNA linc00513调控Ⅰ型干扰素通路参与系统性红斑狼疮的作用机制。2.通过IFN刺激免疫细胞亚群,筛选出在各细胞亚群中特异性表达和响应IFN刺激的长链非编码RNA,作为检测SLE疾病进程的生物标志物。方法:1.对SLE患者进行RNA-Seq测序分析,同时结合GWAS数据库筛选带有狼疮易感位点的lncRNA。2.Luciferase实验检测狼疮易感位点是否影响linc00513表达。3.转染和刺激Hela细胞以研究linc00513功能,GO分析lncRNA调控的基因类型,确定lncRNA调控的信号通路。4.以ASO等方法敲低linc00513的表达水平,Western Blot及流式成像技术检测IFN刺激后linc00513对STAT1和STAT2的磷酸化及其入核情况的影响。5.通过SLEDAI评分及linc00513表达水平分析疾病活动程度和linc00513表达水平的关系。6.将健康人的免疫细胞分为CD14~+、CD19~+、CD4~+、CD56~+和CD8~+五个亚群,IFN刺激后进行转录组分析,以fold change>2,FPKM值总和大于100为标准筛选出在各个亚群特异性表达且响应IFN刺激的lncRNA,作为检测疾病进程的生物标志物的候选lncRNA。结果:筛选出狼疮相关区域的lncRNA——linc00513,且其启动子区域存在狼疮易感位点(rs205764和rs547311)。确定rs205764的G等位基因和rs547311的A等位基因会增强linc00513启动子的转录活性。RT-PCR结果显示linc00513促进了IFN通路下游基因的表达,通过Western Blot实验证明linc00513对IFN通路上关键转录因子STAT1和STAT2的磷酸化存在正向调控。同时流式成像结果显示linc00513也影响p-STAT1入核。SLEDAI评分结果表明linc00513表达水平与IFN评分呈显著正相关。通过对不同细胞亚群中lncRNA表达量和受IFN刺激后变化倍数,筛选出各个亚群中具有选择性表达和特异性响应IFN刺激的lncRNA作为后续筛选生物标志物的候选基因。结论:本研究第一部分结果揭示了linc00513通过影响IFN信号通路下游基因的表达,从而在狼疮发病机制中起调控作用。第二部分根据筛选策略,选出了若干lncRNA作为检测SLE疾病进程的生物标志物的候选对象。总而言之,该项研究为未来检测SLE疾病进程提供新的策略。
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